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Comparative pathogenomics of Listeria ( Total 33 genomes available )

 Virulence factors   Related genes   L. innocua Clip11262 (serovar 6a)   L. ivanovii subsp. ivanovii PAM 55   L. monocytogenes 07PF0776 (serotype 4b)   L. monocytogenes 08-5578 (serotype 1/2a)   L. monocytogenes 08-5923 (serotype 1/2a)   L. monocytogenes 10403S   L. monocytogenes ATCC 19117 (serotype 4d)   L. monocytogenes EGD-e (serovar 1/2a)   L. monocytogenes FSL R2-561   L. monocytogenes Finland 1998   L. monocytogenes HCC23 (serotype 4a)   L. monocytogenes J0161   L. monocytogenes J1-220 (serotype 4b)   L. monocytogenes J1816 (serotype 4b)   L. monocytogenes L312 (serotype 4b)   L. monocytogenes L99 (serotype 4a)   L. monocytogenes M7 (serovar 4a)   L. monocytogenes N53-1   L. monocytogenes SLCC2372 (serotype 1/2c)   L. monocytogenes SLCC2376 (serotype 4c)   L. monocytogenes SLCC2378 (serotype 4e)   L. monocytogenes SLCC2479 (serotype 3c)   L. monocytogenes SLCC2540 (serotype 3b)   L. monocytogenes SLCC2755 (serotype 1/2b)   L. monocytogenes SLCC5850 (serotype 1/2a)   L. monocytogenes SLCC7179 (serotype 3a)   L. monocytogenes serotype 4b str. CLIP 80459   L. monocytogenes serotype 4b str. F2365 (serovar 4b)   L. monocytogenes serotype 4b str. LL195   L. monocytogenes serotype 7 str. SLCC2482   L. monocytogenes str. La111   L. seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954   L. welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 
 chromosome 
 NC_003212 
 chromosome 
 NC_016011 
 chromosome 
 NC_017728 
 chromosome 
 NC_013766 
 chromosome 
 NC_013768 
 chromosome 
 NC_017544 
 chromosome 
 NC_018584 
 chromosome 
 NC_003210 
 chromosome 
 NC_017546 
 chromosome 
 NC_017547 
 chromosome 
 NC_011660 
 chromosome 
 NC_017545 
 chromosome 
 NC_021829 
 chromosome 
 NC_021830 
 chromosome 
 NC_018642 
 chromosome 
 NC_017529 
 chromosome 
 NC_017537 
 chromosome 
 NC_020558 
 chromosome 
 NC_018588 
 chromosome 
 NC_018590 
 chromosome 
 NC_018585 
 chromosome 
 NC_018589 
 chromosome 
 NC_018586 
 chromosome 
 NC_018587 
 chromosome 
 NC_018592 
 chromosome 
 NC_018593 
 chromosome 
 NC_012488 
 chromosome 
 NC_002973 
 chromosome 
 NC_019556 
 chromosome 
 NC_018591 
 chromosome 
 NC_020557 
 chromosome 
 NC_013891 
 chromosome 
 NC_008555 
Adherence
 Ami   ami   LIN_RS13985 
   MUO_RS12810 
 LM5578_RS13960 
 LM5923_RS13730 
 LMRG_RS12980 
 LMOATCC19117_RS13075 
 lmo2558 
 LMKG_RS13365 
 LMLG_RS12790 
 LMHCC_RS00170* 
 LMOG_RS13225 
 LM1816_RS13670 
 LM220_RS07185 
 LMOL312_RS12860* 
 LMO4A_RS13280 
 LMM7_RS13295* 
 BN419_RS12920* 
 LMOSLCC2372_RS13655 
 LMOSLCC2376_RS12505 
 LMOSLCC2378_RS13015 
 LMOSLCC2479_RS13385 
 LMOSLCC2540_RS13155 
 LMOSLCC2755_RS13350 
 LMOSLCC5850_RS13035 
 LMOSLCC7179_RS12650 
 LM4B_RS12860 
 LMOF2365_RS12820 
 BN389_RS12835 
 LMOSLCC2482_RS13230* 
 BN418_RS12870* 
 LSE_RS12520 
 LWE_RS12835 
 FbpA   fbpA   LIN_RS10010 
 LIV_RS09325 
 MUO_RS09330 
 LM5578_RS10210 
 LM5923_RS09990 
 LMRG_RS09250 
 LMOATCC19117_RS09365 
 lmo1829 
 LMKG_RS09615 
 LMLG_RS09335 
 LMHCC_RS03695 
 LMOG_RS09410 
 LM1816_RS09965 
 LM220_RS10990 
 LMOL312_RS09335 
 LMO4A_RS09755 
 LMM7_RS09770 
 BN419_RS09225 
 LMOSLCC2372_RS09890 
 LMOSLCC2376_RS09090 
 LMOSLCC2378_RS09360 
 LMOSLCC2479_RS09620 
 LMOSLCC2540_RS09640 
 LMOSLCC2755_RS09875 
 LMOSLCC5850_RS09555 
 LMOSLCC7179_RS09185 
 LM4B_RS09335 
 LMOF2365_RS09335 
 BN389_RS09355 
 LMOSLCC2482_RS09790 
 BN418_RS09195 
 LSE_RS09125 
 LWE_RS09425 
 InlF 
(Internalin F) 
 inlF       MUO_RS02180 
 LM5578_RS02235 
 LM5923_RS02235 
 LMRG_RS02110 
 LMOATCC19117_RS02250 
 lmo0409 
 LMKG_RS02125 
 LMLG_RS02160* 
     LM1816_RS02565 
 LM220_RS03440 
 LMOL312_RS02160 
       LMOSLCC2372_RS02390 
   LMOSLCC2378_RS02190 
 LMOSLCC2479_RS02125 
 LMOSLCC2540_RS02180 
 LMOSLCC2755_RS02450 
 LMOSLCC5850_RS02110 
 LMOSLCC7179_RS02070 
 LM4B_RS02160 
 LMOF2365_RS02180 
 BN389_RS02185 
 LMOSLCC2482_RS02410 
   LSE_RS03325 
 
 InlJ 
(Internalin J) 
 inlJ       MUO_RS14235 
 LM5578_RS00185 
 LM5923_RS00185 
 LMRG_RS14355 
 LMOATCC19117_RS14430 
 lmo2821 
 LMKG_RS14805 
 LMLG_RS14100 
   LMOG_RS14910 
 LM1816_RS15020 
 LM220_RS05780 
 LMOL312_RS14245 
     BN419_RS14285* 
 LMOSLCC2372_RS15090 
 LMOSLCC2376_RS13875 
 LMOSLCC2378_RS14440 
 LMOSLCC2479_RS14810 
 LMOSLCC2540_RS14570 
 LMOSLCC2755_RS14755 
 LMOSLCC5850_RS14405 
 LMOSLCC7179_RS14300 
 LM4B_RS14245 
 LMOF2365_RS14250 
 BN389_RS14265* 
 LMOSLCC2482_RS14630 
 BN418_RS14235* 
 LSE_RS04680 
 
 InlP 
(Internalin P) 
 inlP       MUO_RS12375 
 LM5578_RS13520 
 LM5923_RS13290 
 LMRG_RS12540 
 LMOATCC19117_RS12640 
 lmo2470 
 LMKG_RS12925 
 LMLG_RS12350 
   LMOG_RS12785 
 LM1816_RS13230 
 LM220_RS07620 
 LMOL312_RS12425 
     BN419_RS12470* 
 LMOSLCC2372_RS13215 
 LMOSLCC2376_RS12070 
 LMOSLCC2378_RS12580 
 LMOSLCC2479_RS12945 
 LMOSLCC2540_RS12715 
 LMOSLCC2755_RS12910 
 LMOSLCC5850_RS12595 
 LMOSLCC7179_RS12210 
 LM4B_RS12425 
 LMOF2365_RS12385 
 BN389_RS12400 
 LMOSLCC2482_RS12790 
 BN418_RS12420* 
   
 Lap 
(Listeria adhesion protein) 
 lap   LIN_RS08520 
 LIV_RS08165 
 MUO_RS08205 
 LM5578_RS08830 
 LM5923_RS08610 
 LMRG_RS08145 
 LMOATCC19117_RS08245 
 lmo1634 
 LMKG_RS08495 
 LMLG_RS08205 
 LMHCC_RS04805 
 LMOG_RS08305 
 LM1816_RS08850 
 LM220_RS12095 
 LMOL312_RS08205 
 LMO4A_RS08650 
 LMM7_RS08660 
 BN419_RS08105 
 LMOSLCC2372_RS08775 
 LMOSLCC2376_RS07965 
 LMOSLCC2378_RS08235 
 LMOSLCC2479_RS08505 
 LMOSLCC2540_RS08525 
 LMOSLCC2755_RS08490 
 LMOSLCC5850_RS08450 
 LMOSLCC7179_RS08080 
 LM4B_RS08205 
 LMOF2365_RS08215 
 BN389_RS08230 
 LMOSLCC2482_RS08680 
 BN418_RS08075 
 LSE_RS07725 
 LWE_RS08305 
 LapB   lapB       MUO_RS08380 
 LM5578_RS08990 
 LM5923_RS08770 
 LMRG_RS08305 
 LMOATCC19117_RS08415 
 lmo1666 
 LMKG_RS08655 
 LMLG_RS08365 
   LMOG_RS08455 
 LM1816_RS09015 
 LM220_RS11925 
 LMOL312_RS08380 
     BN419_RS08260* 
 LMOSLCC2372_RS08935 
   LMOSLCC2378_RS08410 
 LMOSLCC2479_RS08665 
 LMOSLCC2540_RS08700 
 LMOSLCC2755_RS08665 
 LMOSLCC5850_RS08610 
 LMOSLCC7179_RS08240 
 LM4B_RS08380 
 LMOF2365_RS08385 
 BN389_RS08405 
 LMOSLCC2482_RS08855 
 BN418_RS08230* 
 LSE_RS08115 
 
Invasion
 Auto   aut         LM5578_RS05775 
 LM5923_RS05555 
 LMRG_RS05420 
   lmo1076 
 LMKG_RS05490 
 LMLG_RS05495 
   LMOG_RS05575* 
           BN419_RS05365 
 LMOSLCC2372_RS05755 
   LMOSLCC2378_RS05495 
 LMOSLCC2479_RS05490 
 LMOSLCC2540_RS05390 
 LMOSLCC2755_RS05725 
 LMOSLCC5850_RS05420 
 LMOSLCC7179_RS05355 
       LMOSLCC2482_RS05915 
 BN418_RS05340 
 LSE_RS04855 
 
 InlA 
(Internalin A) 
 inlA     LIV_RS01845 
 MUO_RS02355 
 LM5578_RS02350 
 LM5923_RS02350 
 LMRG_RS02225 
 LMOATCC19117_RS02430 
 lmo0433 
 LMKG_RS02240 
 LMLG_RS02275 
 LMHCC_RS11030 
 LMOG_RS02320 
 LM1816_RS02735 
 LM220_RS03285 
 LMOL312_RS02295 
 LMO4A_RS02420 
 LMM7_RS02430 
 BN419_RS02145* 
 LMOSLCC2372_RS02505 
 LMOSLCC2376_RS02195 
 LMOSLCC2378_RS02370 
 LMOSLCC2479_RS02240* 
 LMOSLCC2540_RS02280 
 LMOSLCC2755_RS02550 
 LMOSLCC5850_RS02225 
 LMOSLCC7179_RS02185 
 LM4B_RS02295 
 LMOF2365_RS02360 
 BN389_RS02365 
 LMOSLCC2482_RS02510 
 BN418_RS02135* 
   
 InlB 
(Internalin B) 
 inlB     LIV_RS01865 
 MUO_RS02360 
 LM5578_RS02355 
 LM5923_RS02355 
 LMRG_RS02230 
 LMOATCC19117_RS02435 
 lmo0434 
 LMKG_RS02245 
 LMLG_RS02280 
 LMHCC_RS11025 
 LMOG_RS02325 
 LM1816_RS02740 
 LM220_RS03280 
 LMOL312_RS02300 
 LMO4A_RS02425 
 LMM7_RS02435 
 BN419_RS02150 
 LMOSLCC2372_RS02510 
 LMOSLCC2376_RS02200 
 LMOSLCC2378_RS02375 
 LMOSLCC2479_RS02245 
 LMOSLCC2540_RS02285 
 LMOSLCC2755_RS02555 
 LMOSLCC5850_RS02230 
 LMOSLCC7179_RS02190 
 LM4B_RS02300 
 LMOF2365_RS02365* 
 BN389_RS02370 
 LMOSLCC2482_RS02515 
 BN418_RS02140 
   
 LpeA 
(Lipoprotein promoting entry) 
 lpeA   LIN_RS10100 
 LIV_RS09415 
 MUO_RS09420 
 LM5578_RS10300 
 LM5923_RS10080 
 LMRG_RS09340 
 LMOATCC19117_RS09455 
 lmo1847 
 LMKG_RS09705 
 LMLG_RS09425 
 LMHCC_RS03600 
 LMOG_RS09500 
 LM1816_RS10055 
 LM220_RS10900 
 LMOL312_RS09425 
 LMO4A_RS09850 
 LMM7_RS09865 
 BN419_RS09315 
 LMOSLCC2372_RS09980 
 LMOSLCC2376_RS09185 
 LMOSLCC2378_RS09450 
 LMOSLCC2479_RS09710 
 LMOSLCC2540_RS09730 
 LMOSLCC2755_RS09965 
 LMOSLCC5850_RS09645 
 LMOSLCC7179_RS09275 
 LM4B_RS09425 
 LMOF2365_RS09425 
 BN389_RS09445 
 LMOSLCC2482_RS09880 
 BN418_RS09290 
 LSE_RS09215 
 LWE_RS09515 
 p60   iap/cwhA   LIN_RS03050 
 LIV_RS02630 
 MUO_RS03040 
 LM5578_RS03060 
 LM5923_RS03060 
 LMRG_RS02910 
 LMOATCC19117_RS03120 
 lmo0582 
 LMKG_RS02990 
 LMLG_RS02965 
 LMHCC_RS10315 
 LMOG_RS03070 
   LM220_RS02595* 
 LMOL312_RS03010 
 LMO4A_RS03135 
 LMM7_RS03145 
 BN419_RS02840 
 LMOSLCC2372_RS03255 
 LMOSLCC2376_RS02835 
 LMOSLCC2378_RS03055 
 LMOSLCC2479_RS02990 
 LMOSLCC2540_RS02945 
 LMOSLCC2755_RS03275 
 LMOSLCC5850_RS02910 
 LMOSLCC7179_RS02855 
 LM4B_RS03010 
 LMOF2365_RS03045 
 BN389_RS03050 
 LMOSLCC2482_RS03240 
 BN418_RS02825* 
   
 Vip 
(Virulence protein) 
 vip       MUO_RS01740 
       LMOATCC19117_RS01780 
 lmo0320 
 LMKG_RS01685 
 LMLG_RS01720 
   LMOG_RS01645 
 LM1816_RS02095 
 LM220_RS03900 
 LMOL312_RS01675 
     BN419_RS01570 
 LMOSLCC2372_RS01950 
   LMOSLCC2378_RS01750 
 LMOSLCC2479_RS01685 
 LMOSLCC2540_RS01705 
 LMOSLCC2755_RS02005 
   LMOSLCC7179_RS01620 
 LM4B_RS01675 
 LMOF2365_RS01740 
 BN389_RS01745 
 LMOSLCC2482_RS01965 
 BN418_RS01560 
   
Motility
 ActA   actA       MUO_RS01070 
 LM5578_RS14285 
 LM5923_RS14055 
 LMRG_RS00985 
 LMOATCC19117_RS01075 
 lmo0204 
 LMKG_RS01025 
 LMLG_RS01055 
 LMHCC_RS12295 
 LMOG_RS01040 
   LM220_RS04520* 
 LMOL312_RS01020 
 LMO4A_RS01155 
 LMM7_RS01160 
 BN419_RS00940* 
 LMOSLCC2372_RS01290 
 LMOSLCC2376_RS00875 
 LMOSLCC2378_RS01070 
 LMOSLCC2479_RS01025 
 LMOSLCC2540_RS01015 
 LMOSLCC2755_RS01325 
 LMOSLCC5850_RS00985 
 LMOSLCC7179_RS01005 
 LM4B_RS01020 
 LMOF2365_RS01065 
 BN389_RS01065 
 LMOSLCC2482_RS01285 
 BN418_RS00930* 
   
Exotoxin
 LLO 
(Listeriolysin O) 
 hly     LIV_RS00875 
 MUO_RS01060 
 LM5578_RS14295 
 LM5923_RS14065 
 LMRG_RS00975 
 LMOATCC19117_RS01065 
 lmo0202 
 LMKG_RS01015 
 LMLG_RS01045 
 LMHCC_RS12305 
 LMOG_RS01030 
 LM1816_RS01385 
 LM220_RS04530 
 LMOL312_RS01010 
 LMO4A_RS01145 
 LMM7_RS01150 
 BN419_RS00930 
 LMOSLCC2372_RS01280 
 LMOSLCC2376_RS00865 
 LMOSLCC2378_RS01060 
 LMOSLCC2479_RS01015 
 LMOSLCC2540_RS01005 
 LMOSLCC2755_RS01315 
 LMOSLCC5850_RS00975 
 LMOSLCC7179_RS00995 
 LM4B_RS01010 
 LMOF2365_RS01055 
 BN389_RS01055 
 LMOSLCC2482_RS01275 
 BN418_RS00920 
 LSE_RS00905 
 
 PlcA 
(PI-PLC) 
 plcA       MUO_RS01055 
 LM5578_RS14300 
 LM5923_RS14070 
 LMRG_RS00970 
 LMOATCC19117_RS01060 
 lmo0201 
 LMKG_RS01010 
 LMLG_RS01040 
 LMHCC_RS12310 
 LMOG_RS01025 
 LM1816_RS01380 
 LM220_RS04535 
 LMOL312_RS01005 
 LMO4A_RS01140 
 LMM7_RS01145 
 BN419_RS00925 
 LMOSLCC2372_RS01275 
 LMOSLCC2376_RS00860 
 LMOSLCC2378_RS01055 
 LMOSLCC2479_RS01010 
 LMOSLCC2540_RS01000 
 LMOSLCC2755_RS01310 
 LMOSLCC5850_RS00970 
 LMOSLCC7179_RS00990* 
 LM4B_RS01005 
 LMOF2365_RS01050 
 BN389_RS01050 
 LMOSLCC2482_RS01270 
 BN418_RS00915 
 LSE_RS00900 
 
 PlcB 
(PC-PLC) 
 plcB       MUO_RS01075 
 LM5578_RS14280 
 LM5923_RS14050 
 LMRG_RS00990 
 LMOATCC19117_RS01080 
 lmo0205 
 LMKG_RS01030 
 LMLG_RS01060 
 LMHCC_RS12290 
 LMOG_RS01045 
 LM1816_RS01400 
 LM220_RS04515 
 LMOL312_RS01025 
 LMO4A_RS01160 
 LMM7_RS01165 
 BN419_RS00945 
 LMOSLCC2372_RS01295 
 LMOSLCC2376_RS00880 
 LMOSLCC2378_RS01075 
 LMOSLCC2479_RS01030 
 LMOSLCC2540_RS01020 
 LMOSLCC2755_RS01330 
 LMOSLCC5850_RS00990 
 LMOSLCC7179_RS01010 
 LM4B_RS01025 
 LMOF2365_RS01070 
 BN389_RS01070 
 LMOSLCC2482_RS01290 
 BN418_RS00935 
 LSE_RS00930 
 
Exoenzyme
 Mpl   mpl       MUO_RS01065 
 LM5578_RS14290 
 LM5923_RS14060 
 LMRG_RS00980 
 LMOATCC19117_RS01070 
 lmo0203 
 LMKG_RS01020 
 LMLG_RS01050 
 LMHCC_RS12300 
 LMOG_RS01035 
 LM1816_RS01390 
 LM220_RS04525 
 LMOL312_RS01015 
 LMO4A_RS01150 
 LMM7_RS01155 
 BN419_RS00935 
 LMOSLCC2372_RS01285 
 LMOSLCC2376_RS00870 
 LMOSLCC2378_RS01065 
 LMOSLCC2479_RS01020 
 LMOSLCC2540_RS01010 
 LMOSLCC2755_RS01320 
 LMOSLCC5850_RS00980 
 LMOSLCC7179_RS01000 
 LM4B_RS01015 
 LMOF2365_RS01060 
 BN389_RS01060 
 LMOSLCC2482_RS01280 
 BN418_RS00925 
 LSE_RS00915 
 
Immune modulation
 InlC   inlC     LIV_RS12965 
 MUO_RS09115 
 LM5578_RS09995 
 LM5923_RS09775 
 LMRG_RS09035 
 LMOATCC19117_RS09150 
 lmo1786 
 LMKG_RS09400 
 LMLG_RS09105 
   LMOG_RS09195 
 LM1816_RS09750 
 LM220_RS11205 
 LMOL312_RS09120 
     BN419_RS09005 
 LMOSLCC2372_RS09675 
   LMOSLCC2378_RS09145 
 LMOSLCC2479_RS09405 
 LMOSLCC2540_RS09425 
 LMOSLCC2755_RS09660 
 LMOSLCC5850_RS09340 
 LMOSLCC7179_RS08970 
 LM4B_RS09120 
 LMOF2365_RS09120 
 BN389_RS09140 
 LMOSLCC2482_RS09575 
 BN418_RS08975 
   
 InlK   inlK       MUO_RS06495 
 LM5578_RS07090 
 LM5923_RS06870 
 LMRG_RS06415 
 LMOATCC19117_RS06535 
 lmo1290 
 LMKG_RS06765 
 LMLG_RS06485 
 LMHCC_RS06555 
 LMOG_RS06580 
 LM1816_RS07130 
 LM220_RS13810 
 LMOL312_RS06485 
 LMO4A_RS06900 
 LMM7_RS06910 
 BN419_RS06350* 
 LMOSLCC2372_RS07045 
 LMOSLCC2376_RS06255 
 LMOSLCC2378_RS06525 
 LMOSLCC2479_RS06775 
 LMOSLCC2540_RS06690 
 LMOSLCC2755_RS06770 
 LMOSLCC5850_RS06720 
 LMOSLCC7179_RS06360 
 LM4B_RS06485 
 LMOF2365_RS06505 
 BN389_RS06520 
 LMOSLCC2482_RS06960 
 BN418_RS06320 
   
 LntA 
(Listeria nuclear targeted protein A) 
 lntA       MUO_RS02375 
 LM5578_RS02370 
 LM5923_RS02370 
 LMRG_RS02245 
 LMOATCC19117_RS02450 
 lmo0438 
 LMKG_RS02270 
 LMLG_RS02295 
   LMOG_RS02350 
 LM1816_RS02755 
 LM220_RS03265 
 LMOL312_RS02315 
     BN419_RS02175* 
 LMOSLCC2372_RS02535 
 LMOSLCC2376_RS02220 
 LMOSLCC2378_RS02390 
 LMOSLCC2479_RS02270 
 LMOSLCC2540_RS02305 
 LMOSLCC2755_RS02570 
 LMOSLCC5850_RS02245 
 LMOSLCC7179_RS02205 
 LM4B_RS02315 
 LMOF2365_RS02380 
 BN389_RS02385 
 LMOSLCC2482_RS02530 
 BN418_RS02165 
   
 OatA   oatA   LIN_RS06790 
 LIV_RS06365 
 MUO_RS06500 
 LM5578_RS07095 
 LM5923_RS06875 
 LMRG_RS06420 
 LMOATCC19117_RS06540 
 lmo1291 
 LMKG_RS06770 
 LMLG_RS06490 
 LMHCC_RS06550 
 LMOG_RS06585 
 LM1816_RS07135 
 LM220_RS13805 
 LMOL312_RS06490 
 LMO4A_RS06905 
 LMM7_RS06915 
 BN419_RS06355 
 LMOSLCC2372_RS07050 
 LMOSLCC2376_RS06260 
 LMOSLCC2378_RS06530 
 LMOSLCC2479_RS06780 
 LMOSLCC2540_RS06695 
 LMOSLCC2755_RS06775 
 LMOSLCC5850_RS06725* 
 LMOSLCC7179_RS06365 
 LM4B_RS06490 
 LMOF2365_RS06510 
 BN389_RS06525 
 LMOSLCC2482_RS06965 
 BN418_RS06325 
 LSE_RS06005 
 LWE_RS06590 
 PgdA   pdgA   LIN_RS02285 
 LIV_RS01815 
 MUO_RS02205 
 LM5578_RS02260 
 LM5923_RS02260 
 LMRG_RS02135 
 LMOATCC19117_RS02275 
 lmo0415 
 LMKG_RS02150 
 LMLG_RS02185 
 LMHCC_RS11170 
 LMOG_RS02230 
 LM1816_RS02590 
 LM220_RS03415 
 LMOL312_RS02185 
 LMO4A_RS02275 
 LMM7_RS02285 
 BN419_RS02055 
 LMOSLCC2372_RS02415 
 LMOSLCC2376_RS02095 
 LMOSLCC2378_RS02215* 
 LMOSLCC2479_RS02150 
 LMOSLCC2540_RS02205 
 LMOSLCC2755_RS02475 
 LMOSLCC5850_RS02135 
 LMOSLCC7179_RS02095 
 LM4B_RS02185 
 LMOF2365_RS02205 
 BN389_RS02210 
 LMOSLCC2482_RS02435 
 BN418_RS02045 
 LSE_RS01900* 
 LWE_RS01950 
Nutritional/Metabolic factor
 Hpt 
(Hexose phosphate transporter) 
 hpt     LIV_RS03955 
 MUO_RS04265 
 LM5578_RS04560 
 LM5923_RS04340 
 LMRG_RS04195 
 LMOATCC19117_RS04345 
 lmo0838 
 LMKG_RS04275 
 LMLG_RS04265 
 LMHCC_RS09050 
 LMOG_RS04365 
   LM220_RS01370* 
 LMOL312_RS04245 
 LMO4A_RS04400 
 LMM7_RS04410 
 BN419_RS04135* 
 LMOSLCC2372_RS04540 
 LMOSLCC2376_RS04060 
 LMOSLCC2378_RS04285 
 LMOSLCC2479_RS04275 
 LMOSLCC2540_RS04185 
 LMOSLCC2755_RS04515 
 LMOSLCC5850_RS04195 
 LMOSLCC7179_RS04130 
 LM4B_RS04245 
 LMOF2365_RS04270 
 BN389_RS04280 
 LMOSLCC2482_RS04710 
 BN418_RS04115* 
 LSE_RS03695 
 
 LplA1   lplA1   LIN_RS04760 
 LIV_RS04475 
 MUO_RS04760 
 LM5578_RS05040 
 LM5923_RS04820 
 LMRG_RS04685 
 LMOATCC19117_RS04840 
 lmo0931 
 LMKG_RS04755 
 LMLG_RS04755 
 LMHCC_RS08550 
 LMOG_RS04845 
 LM1816_RS05150 
 LM220_RS00880 
 LMOL312_RS04745 
 LMO4A_RS04905 
 LMM7_RS04915 
 BN419_RS04635* 
 LMOSLCC2372_RS05020 
 LMOSLCC2376_RS04555 
 LMOSLCC2378_RS04785 
 LMOSLCC2479_RS04755 
 LMOSLCC2540_RS04680 
 LMOSLCC2755_RS05015 
 LMOSLCC5850_RS04685 
 LMOSLCC7179_RS04620 
 LM4B_RS04745 
 LMOF2365_RS04765 
 BN389_RS04780 
 LMOSLCC2482_RS05205 
 BN418_RS04610* 
 LSE_RS04160 
 LWE_RS04635 
 Oligopeptide-binding protein oppA   oppA   LIN_RS11825 
 LIV_RS11260 
 MUO_RS11225 
 LM5578_RS12085 
 LM5923_RS11865 
 LMRG_RS11140 
 LMOATCC19117_RS11270 
 lmo2196 
 LMKG_RS11485 
 LMLG_RS11205 
 LMHCC_RS01790 
 LMOG_RS11290 
 LM1816_RS11855 
 LM220_RS09090 
 LMOL312_RS11240 
 LMO4A_RS11660 
 LMM7_RS11675 
 BN419_RS11115 
 LMOSLCC2372_RS11760 
 LMOSLCC2376_RS10925 
 LMOSLCC2378_RS11255 
 LMOSLCC2479_RS11490 
 LMOSLCC2540_RS11575 
 LMOSLCC2755_RS11770 
 LMOSLCC5850_RS11445 
 LMOSLCC7179_RS11070 
 LM4B_RS11240 
 LMOF2365_RS11235 
 BN389_RS11250 
 LMOSLCC2482_RS11650 
 BN418_RS11090 
 LSE_RS10970 
 LWE_RS11260 
 SvpA 
(Surface-virulence associated protein) 
 hbp2   LIN_RS11770 
 LIV_RS11205 
 MUO_RS11170 
 LM5578_RS12030 
 LM5923_RS11810 
 LMRG_RS11085 
 LMOATCC19117_RS11215 
 lmo2185 
 LMKG_RS11430 
 LMLG_RS11150 
 LMHCC_RS01845 
 LMOG_RS11235 
 LM1816_RS11800 
 LM220_RS09145 
 LMOL312_RS11185 
 LMO4A_RS11605 
 LMM7_RS11620 
 BN419_RS11060 
 LMOSLCC2372_RS11705 
 LMOSLCC2376_RS10870 
 LMOSLCC2378_RS11200 
 LMOSLCC2479_RS11435 
 LMOSLCC2540_RS11520 
 LMOSLCC2755_RS11715 
 LMOSLCC5850_RS11390 
 LMOSLCC7179_RS11015 
 LM4B_RS11185 
 LMOF2365_RS11180 
 BN389_RS11195 
 LMOSLCC2482_RS11595 
 BN418_RS11035 
 LSE_RS10915 
 LWE_RS11205 
Stress survival
 BSH   bsh     LIV_RS10550 
 MUO_RS10535 
 LM5578_RS11405 
 LM5923_RS11185 
 LMRG_RS10440 
 LMOATCC19117_RS10575 
 lmo2067 
 LMKG_RS10805 
 LMLG_RS10525 
 LMHCC_RS02525 
 LMOG_RS10600 
 LM1816_RS11165 
 LM220_RS09780 
 LMOL312_RS10550 
 LMO4A_RS10925 
 LMM7_RS10940 
   LMOSLCC2372_RS11080 
 LMOSLCC2376_RS10240 
 LMOSLCC2378_RS10565 
 LMOSLCC2479_RS10810 
 LMOSLCC2540_RS10890 
 LMOSLCC2755_RS11080 
 LMOSLCC5850_RS10745 
 LMOSLCC7179_RS10380 
 LM4B_RS10550 
 LMOF2365_RS10540 
 BN389_RS10560 
 LMOSLCC2482_RS10965 
   LSE_RS10340 
 
Post-translational modification
 D-alanine-polyphosphoribitol ligase DltA   dltA   LIN_RS04970 
 LIV_RS04720 
 MUO_RS04975 
 LM5578_RS05260 
 LM5923_RS05040 
 LMRG_RS04905 
 LMOATCC19117_RS05055 
 lmo0974 
 LMKG_RS04975 
 LMLG_RS04970 
 LMHCC_RS08330 
 LMOG_RS05060 
 LM1816_RS05365 
 LM220_RS00665 
 LMOL312_RS04960 
 LMO4A_RS05125 
 LMM7_RS05135 
 BN419_RS04850 
 LMOSLCC2372_RS05240 
 LMOSLCC2376_RS04770 
 LMOSLCC2378_RS05000 
 LMOSLCC2479_RS04975 
 LMOSLCC2540_RS04895 
 LMOSLCC2755_RS05230 
 LMOSLCC5850_RS04905* 
 LMOSLCC7179_RS04840 
 LM4B_RS04960 
 LMOF2365_RS04980 
 BN389_RS04995 
 LMOSLCC2482_RS05420 
 BN418_RS04825 
 LSE_RS04405 
 LWE_RS04865 
 GtcA   gtcA   LIN_RS13940 
 LIV_RS12780 
 MUO_RS12770 
 LM5578_RS13915 
 LM5923_RS13685 
 LMRG_RS12935 
 LMOATCC19117_RS13035 
 lmo2549 
 LMKG_RS13320 
 LMLG_RS12745 
 LMHCC_RS00210 
 LMOG_RS13180 
 LM1816_RS13630 
 LM220_RS07225 
 LMOL312_RS12820 
 LMO4A_RS13240 
 LMM7_RS13255 
 BN419_RS12875 
 LMOSLCC2372_RS13610 
 LMOSLCC2376_RS12465 
 LMOSLCC2378_RS12975 
 LMOSLCC2479_RS13340 
 LMOSLCC2540_RS13110 
 LMOSLCC2755_RS13305 
 LMOSLCC5850_RS12990 
 LMOSLCC7179_RS12605 
 LM4B_RS12820 
 LMOF2365_RS12780 
 BN389_RS12795 
 LMOSLCC2482_RS13185 
 BN418_RS12825 
 LSE_RS12475 
 LWE_RS12790 
 Lipoprotein diacylglyceryl transferase lgt   lgt   LIN_RS13600 
 LIV_RS12415 
 MUO_RS12435 
 LM5578_RS13580 
 LM5923_RS13350 
 LMRG_RS12600 
 LMOATCC19117_RS12700 
 lmo2482 
 LMKG_RS12985 
 LMLG_RS12410 
 LMHCC_RS00545 
 LMOG_RS12845 
 LM1816_RS13290 
 LM220_RS07560 
 LMOL312_RS12485 
 LMO4A_RS12905 
 LMM7_RS12920 
 BN419_RS12530 
 LMOSLCC2372_RS13275 
 LMOSLCC2376_RS12130 
 LMOSLCC2378_RS12640 
 LMOSLCC2479_RS13005 
 LMOSLCC2540_RS12775 
 LMOSLCC2755_RS12970 
 LMOSLCC5850_RS12655 
 LMOSLCC7179_RS12270 
 LM4B_RS12485 
 LMOF2365_RS12445 
 BN389_RS12460 
 LMOSLCC2482_RS12850 
 BN418_RS12480 
 LSE_RS12110 
 LWE_RS12445 
 Lsp   lspA   LIN_RS10085 
 LIV_RS09400 
 MUO_RS09405 
 LM5578_RS10285 
 LM5923_RS10065 
 LMRG_RS09325 
 LMOATCC19117_RS09440 
 lmo1844 
 LMKG_RS09690 
 LMLG_RS09410 
 LMHCC_RS03620 
 LMOG_RS09485 
 LM1816_RS10040 
 LM220_RS10915 
 LMOL312_RS09410 
 LMO4A_RS09830 
 LMM7_RS09845 
 BN419_RS09300 
 LMOSLCC2372_RS09965 
 LMOSLCC2376_RS09165 
 LMOSLCC2378_RS09435 
 LMOSLCC2479_RS09695 
 LMOSLCC2540_RS09715 
 LMOSLCC2755_RS09950 
 LMOSLCC5850_RS09630 
 LMOSLCC7179_RS09260 
 LM4B_RS09410 
 LMOF2365_RS09410 
 BN389_RS09430 
 LMOSLCC2482_RS09865 
 BN418_RS09270 
 LSE_RS09200 
 LWE_RS09500 
 PrsA2   prsA2   LIN_RS11940 
 LIV_RS11375 
 MUO_RS11340 
 LM5578_RS12200 
 LM5923_RS11980 
 LMRG_RS11255 
 LMOATCC19117_RS11385 
 lmo2219 
 LMKG_RS11600 
 LMLG_RS11320 
 LMHCC_RS01675 
 LMOG_RS11405 
 LM1816_RS11970 
 LM220_RS08975 
 LMOL312_RS11355 
 LMO4A_RS11775 
 LMM7_RS11790 
 BN419_RS11230 
 LMOSLCC2372_RS11875 
 LMOSLCC2376_RS11040 
 LMOSLCC2378_RS11370 
 LMOSLCC2479_RS11605 
 LMOSLCC2540_RS11690 
 LMOSLCC2755_RS11885 
 LMOSLCC5850_RS11560 
 LMOSLCC7179_RS11185 
 LM4B_RS11355 
 LMOF2365_RS11350 
 BN389_RS11365 
 LMOSLCC2482_RS11765 
 BN418_RS11205 
 LSE_RS11085 
 LWE_RS11375 
 Serine-threonine phosphatase stp   stp   LIN_RS09970 
 LIV_RS09285 
 MUO_RS09290 
 LM5578_RS10170 
 LM5923_RS09950 
 LMRG_RS09210 
 LMOATCC19117_RS09325 
 lmo1821 
 LMKG_RS09575 
 LMLG_RS09295 
 LMHCC_RS03735 
 LMOG_RS09370 
 LM1816_RS09925 
 LM220_RS11030 
 LMOL312_RS09295 
 LMO4A_RS09715 
 LMM7_RS09730 
 BN419_RS09185* 
 LMOSLCC2372_RS09850 
 LMOSLCC2376_RS09050 
 LMOSLCC2378_RS09320 
 LMOSLCC2479_RS09580 
 LMOSLCC2540_RS09600 
 LMOSLCC2755_RS09835 
 LMOSLCC5850_RS09515 
 LMOSLCC7179_RS09145 
 LM4B_RS09295 
 LMOF2365_RS09295 
 BN389_RS09315 
 LMOSLCC2482_RS09750 
 BN418_RS09155 
 LSE_RS09085 
 LWE_RS09385 
 Sortase A   srtA   LIN_RS04750 
   MUO_RS04750 
 LM5578_RS05030 
 LM5923_RS04810 
 LMRG_RS04675 
 LMOATCC19117_RS04830 
 lmo0929 
 LMKG_RS04745 
 LMLG_RS04745 
 LMHCC_RS08560 
 LMOG_RS04835 
 LM1816_RS05140 
 LM220_RS00890 
 LMOL312_RS04735 
 LMO4A_RS04895 
 LMM7_RS04905 
 BN419_RS04625 
 LMOSLCC2372_RS05010 
 LMOSLCC2376_RS04540 
 LMOSLCC2378_RS04775 
 LMOSLCC2479_RS04745 
 LMOSLCC2540_RS04670 
 LMOSLCC2755_RS05005 
 LMOSLCC5850_RS04675 
 LMOSLCC7179_RS04610 
 LM4B_RS04735 
 LMOF2365_RS04755 
 BN389_RS04770 
 LMOSLCC2482_RS05195 
 BN418_RS04600 
 LSE_RS04150 
 LWE_RS04615 
 Sortase B   srtB   LIN_RS11750 
 LIV_RS11185 
 MUO_RS11150 
 LM5578_RS12010 
 LM5923_RS11790 
 LMRG_RS11065 
 LMOATCC19117_RS11195 
 lmo2181 
 LMKG_RS11410 
 LMLG_RS11130 
 LMHCC_RS01865 
 LMOG_RS11215 
 LM1816_RS11780 
 LM220_RS09165 
 LMOL312_RS11165 
 LMO4A_RS11585 
 LMM7_RS11600 
 BN419_RS11040 
 LMOSLCC2372_RS11685 
 LMOSLCC2376_RS10850 
 LMOSLCC2378_RS11180 
 LMOSLCC2479_RS11415 
 LMOSLCC2540_RS11500 
 LMOSLCC2755_RS11695 
 LMOSLCC5850_RS11370 
 LMOSLCC7179_RS10995 
 LM4B_RS11165 
 LMOF2365_RS11160 
 BN389_RS11175 
 LMOSLCC2482_RS11575 
 BN418_RS11015 
 LSE_RS10895 
 LWE_RS11185 
Regulation
 AgrA/AgrC   agrA   LIN_RS00220 
 LIV_RS00245 
 MUO_RS00300 
 LM5578_RS15055 
 LM5923_RS14825 
   LMOATCC19117_RS00305 
 lmo0051 
 LMKG_RS00255 
 LMLG_RS00285 
 LMHCC_RS13240* 
 LMOG_RS00285 
 LM1816_RS00300 
 LM220_RS05295 
 LMOL312_RS00305 
 LMO4A_RS00220* 
 LMM7_RS00220* 
 BN419_RS00255 
 LMOSLCC2372_RS00520 
 LMOSLCC2376_RS00240* 
 LMOSLCC2378_RS00300* 
 LMOSLCC2479_RS00255 
 LMOSLCC2540_RS00285 
 LMOSLCC2755_RS00590 
 LMOSLCC5850_RS00255 
 LMOSLCC7179_RS00285 
 LM4B_RS00305 
 LMOF2365_RS00300 
 BN389_RS00300 
 LMOSLCC2482_RS00550 
 BN418_RS00255 
 LSE_RS00195 
 LWE_RS00210 
 agrC   LIN_RS00215 
 LIV_RS00240 
 MUO_RS00295 
 LM5578_RS15060 
 LM5923_RS14830 
 LMRG_RS00250 
 LMOATCC19117_RS00300 
 lmo0050 
 LMKG_RS00250 
 LMLG_RS00280 
 LMHCC_RS13245 
 LMOG_RS00280 
 LM1816_RS00295 
 LM220_RS05300 
 LMOL312_RS00300 
 LMO4A_RS00215 
 LMM7_RS00215 
 BN419_RS00250* 
 LMOSLCC2372_RS00515 
 LMOSLCC2376_RS00235 
 LMOSLCC2378_RS00295 
 LMOSLCC2479_RS00250 
 LMOSLCC2540_RS00280 
 LMOSLCC2755_RS00585 
 LMOSLCC5850_RS00250 
 LMOSLCC7179_RS00280 
 LM4B_RS00300 
 LMOF2365_RS00295 
 BN389_RS00295 
 LMOSLCC2482_RS00545 
 BN418_RS00250* 
 LSE_RS00190 
 LWE_RS00205* 
 CheA/CheY   cheA   LIN_RS03605 
 LIV_RS03240 
 MUO_RS03620 
 LM5578_RS03835 
 LM5923_RS03615 
 LMRG_RS03475 
 LMOATCC19117_RS03695 
 lmo0692 
 LMKG_RS03545 
 LMLG_RS03525 
 LMHCC_RS09750 
 LMOG_RS03625 
 LM1816_RS04005 
 LM220_RS02050 
 LMOL312_RS03575 
 LMO4A_RS03700 
 LMM7_RS03710 
 BN419_RS03405 
 LMOSLCC2372_RS03810 
 LMOSLCC2376_RS03390 
 LMOSLCC2378_RS03640 
 LMOSLCC2479_RS03545 
 LMOSLCC2540_RS03525 
 LMOSLCC2755_RS03855 
 LMOSLCC5850_RS03475 
 LMOSLCC7179_RS03410 
 LM4B_RS03575 
 LMOF2365_RS03630 
 BN389_RS03635 
 LMOSLCC2482_RS04050 
 BN418_RS03390 
 LSE_RS03035 
 LWE_RS03370 
 cheY   LIN_RS03600 
 LIV_RS03235 
 MUO_RS03615 
 LM5578_RS03830 
 LM5923_RS03610 
 LMRG_RS03470 
 LMOATCC19117_RS03690 
 lmo0691 
 LMKG_RS03540 
 LMLG_RS03520 
 LMHCC_RS09755 
 LMOG_RS03620 
 LM1816_RS04000 
 LM220_RS02055 
 LMOL312_RS03570 
 LMO4A_RS03695 
 LMM7_RS03705 
 BN419_RS03400 
 LMOSLCC2372_RS03805 
 LMOSLCC2376_RS03385 
 LMOSLCC2378_RS03635 
 LMOSLCC2479_RS03540 
 LMOSLCC2540_RS03520 
 LMOSLCC2755_RS03850 
 LMOSLCC5850_RS03470 
 LMOSLCC7179_RS03405 
 LM4B_RS03570 
 LMOF2365_RS03625 
 BN389_RS03630 
 LMOSLCC2482_RS04045 
 BN418_RS03385 
 LSE_RS03030 
 LWE_RS03365 
 LisR/LisK   lisR   LIN_RS07215 
 LIV_RS06795 
 MUO_RS06925 
 LM5578_RS07525 
 LM5923_RS07305 
 LMRG_RS06850 
 LMOATCC19117_RS06965 
 lmo1377 
 LMKG_RS07205 
 LMLG_RS06920 
 LMHCC_RS06120 
 LMOG_RS07015 
 LM1816_RS07565 
 LM220_RS13380 
 LMOL312_RS06915 
 LMO4A_RS07335 
 LMM7_RS07345 
 BN419_RS06795 
 LMOSLCC2372_RS07480 
 LMOSLCC2376_RS06690 
 LMOSLCC2378_RS06955 
 LMOSLCC2479_RS07210 
 LMOSLCC2540_RS07120 
 LMOSLCC2755_RS07200 
 LMOSLCC5850_RS07155 
 LMOSLCC7179_RS06795 
 LM4B_RS06915 
 LMOF2365_RS06935 
 BN389_RS06950 
 LMOSLCC2482_RS07390 
 BN418_RS06765 
 LSE_RS06430 
 LWE_RS07020 
 lisK   LIN_RS07220 
 LIV_RS06800 
 MUO_RS06930 
 LM5578_RS07530 
 LM5923_RS07310 
 LMRG_RS06855 
 LMOATCC19117_RS06970 
 lmo1378 
 LMKG_RS07210 
 LMLG_RS06925* 
 LMHCC_RS06115 
 LMOG_RS07020 
 LM1816_RS07570 
 LM220_RS13375 
 LMOL312_RS06920 
 LMO4A_RS07340 
 LMM7_RS07350 
 BN419_RS06800 
 LMOSLCC2372_RS07485 
 LMOSLCC2376_RS06695 
 LMOSLCC2378_RS06960 
 LMOSLCC2479_RS07215 
 LMOSLCC2540_RS07125 
 LMOSLCC2755_RS07205 
 LMOSLCC5850_RS07160 
 LMOSLCC7179_RS06800 
 LM4B_RS06920 
 LMOF2365_RS06940 
 BN389_RS06955 
 LMOSLCC2482_RS07395 
 BN418_RS06770 
 LSE_RS06435 
 LWE_RS07025 
 PrfA 
(Pleiotropic regulatory factor) 
 prfA     LIV_RS00865 
 MUO_RS01050 
 LM5578_RS14305 
 LM5923_RS14075 
 LMRG_RS00965 
 LMOATCC19117_RS01055 
 lmo0200 
 LMKG_RS01005 
 LMLG_RS01035 
 LMHCC_RS12315 
 LMOG_RS01020 
 LM1816_RS01375 
 LM220_RS04540 
 LMOL312_RS01000 
 LMO4A_RS01135 
 LMM7_RS01140 
 BN419_RS00920 
 LMOSLCC2372_RS01270 
 LMOSLCC2376_RS00855 
 LMOSLCC2378_RS01050 
 LMOSLCC2479_RS01005 
 LMOSLCC2540_RS00995 
 LMOSLCC2755_RS01305 
 LMOSLCC5850_RS00965 
 LMOSLCC7179_RS00985 
 LM4B_RS01000 
 LMOF2365_RS01045 
 BN389_RS01045 
 LMOSLCC2482_RS01265 
 BN418_RS00910 
 LSE_RS00890 
 
 VirR/VirS   virR   LIN_RS09565 
 LIV_RS08890 
 MUO_RS08895 
 LM5578_RS09775 
 LM5923_RS09555 
 LMRG_RS08815 
 LMOATCC19117_RS08930 
 lmo1745 
 LMKG_RS09180 
 LMLG_RS08885 
 LMHCC_RS04145 
 LMOG_RS08975 
 LM1816_RS09530 
 LM220_RS11425 
 LMOL312_RS08900 
 LMO4A_RS09310 
 LMM7_RS09320 
 BN419_RS08780 
 LMOSLCC2372_RS09455 
 LMOSLCC2376_RS08645 
 LMOSLCC2378_RS08925 
 LMOSLCC2479_RS09185 
 LMOSLCC2540_RS09205 
 LMOSLCC2755_RS09440 
 LMOSLCC5850_RS09120 
 LMOSLCC7179_RS08750 
 LM4B_RS08900 
 LMOF2365_RS08900 
 BN389_RS08920 
 LMOSLCC2482_RS09355 
 BN418_RS08750 
 LSE_RS08650 
 LWE_RS08985 
 virS   LIN_RS09545 
 LIV_RS08870 
 MUO_RS08875 
 LM5578_RS09755 
 LM5923_RS09535 
 LMRG_RS08795 
 LMOATCC19117_RS08910 
 lmo1741 
 LMKG_RS09160 
 LMLG_RS08865 
 LMHCC_RS04165 
 LMOG_RS08955 
 LM1816_RS09510 
 LM220_RS11445 
 LMOL312_RS08880 
 LMO4A_RS09290 
 LMM7_RS09300 
 BN419_RS08760 
 LMOSLCC2372_RS09435 
 LMOSLCC2376_RS08625 
 LMOSLCC2378_RS08905 
 LMOSLCC2479_RS09165 
 LMOSLCC2540_RS09185 
 LMOSLCC2755_RS09420 
 LMOSLCC5850_RS09100 
 LMOSLCC7179_RS08730 
 LM4B_RS08880 
 LMOF2365_RS08880 
 BN389_RS08900 
 LMOSLCC2482_RS09335 
 BN418_RS08730 
 LSE_RS08630 
 LWE_RS08965 
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