Home
Search
Category
Status
Feedback
Download
Contacts
Resources



Comparative pathogenomics of Klebsiella ( Total 12 genomes available )

 Virulence factors   Related genes   K. oxytoca E718   K. oxytoca KCTC 1686   K. pneumoniae 342   K. pneumoniae CG43   K. pneumoniae JM45   K. pneumoniae KCTC 2242   K. pneumoniae subsp. pneumoniae 1084   K. pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286   K. pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578   K. pneumoniae subsp. pneumoniae NTUH-K2044   K. pneumoniae subsp. rhinoscleromatis SB3432   K. variicola At-22 
 chromosome 
 NC_018106 
 chromosome 
 NC_016612 
 chromosome 
 NC_011283 
 pLVPK 
 NC_005249 
 chromosome 
 NC_022082 
 chromosome 
 NC_017540 
 pKCTC2242 
 NC_017541 
 chromosome 
 NC_018522 
 chromosome 
 NC_016845 
 chromosome 
 NC_009648 
 chromosome 
 NC_012731 
 pK2044 
 NC_006625 
 chromosome 
 NC_021232 
 chromosome 
 NC_013850 
Adherence
 Type I fimbriae   fimB   A225_3345 
 KOX_22330 
 KPK_0820 
   N559_0951 
 KPN2242_19385 
   A79E_0821 
 KPHS_43520 
 KPN_03285 
 KP1_4567 
   KPR_1744 
 Kvar_0780 
 fimE       KPK_0818 
   N559_0950 
 KPN2242_19390 
   A79E_0820 
 KPHS_43530 
 KPN_03286 
 KP1_4569 
   KPR_1743 
 Kvar_0779 
 fimA   A225_3798 
 KOX_24735 
 KPK_0817 
   N559_0948 
 KPN2242_19395 
   A79E_0819 
 KPHS_43550 
 KPN_03287 
 KP1_4571 
   KPR_1742 
 Kvar_0778 
 fimI   A225_3799 
 KOX_24740 
 KPK_0816 
   N559_0947 
 KPN2242_19400 
   A79E_0818 
 KPHS_43560 
 KPN_03288 
 KP1_4572 
   KPR_1741 
 Kvar_0777 
 fimC   A225_3800 
 KOX_24745 
 KPK_0815 
   N559_0946 
 KPN2242_19405 
   A79E_0817 
 KPHS_43570 
 KPN_03289 
 KP1_4573 
   KPR_1740 
 Kvar_0776 
 fimD   A225_3801 
 KOX_24750 
 KPK_0814 
   N559_0945 
 KPN2242_19410 
   A79E_0816 
 KPHS_43580 
 KPN_03290 
 KP1_4574 
   KPR_1739 
 Kvar_0775 
 fimF   A225_3802 
 KOX_24755 
 KPK_0813 
   N559_0944 
 KPN2242_19415 
   A79E_0815 
 KPHS_43590 
 KPN_03291 
 KP1_4575 
   KPR_1738 
 Kvar_0774 
 fimG   A225_3803 
 KOX_24760 
 KPK_0812 
   N559_0943 
 KPN2242_19420 
   A79E_0814 
 KPHS_43600 
 KPN_03292 
 KP1_4576 
   KPR_1737 
 Kvar_0773 
 fimH   A225_3804 
 KOX_24765 
 KPK_0811 
   N559_0942 
 KPN2242_19425 
   A79E_0813 
 KPHS_43610 
 KPN_03293 
 KP1_4577 
   KPR_1736 
 Kvar_0772 
 fimK   A225_3805 
 KOX_24770 
 KPK_0810 
   N559_0941 
 KPN2242_19430 
   A79E_0812 
 KPHS_43620 
 KPN_03294 
 KP1_4578 
   KPR_1735 
 Kvar_0771 
Effector delivery system
 T6SS   vipA/tssB   A225_3380 
 KOX_22535 
 KPK_3069 
   N559_2931 
 KPN2242_09750 
   A79E_2840 
 KPHS_22970 
 KPN_01322 
 KP1_2392 
   KPR_2378 
 Kvar_2975 
 vipB/tssC   A225_3379 
 KOX_22530 
 KPK_3068 
   N559_2930 
 KPN2242_09755 
   A79E_2839 
 KPHS_22980 
 KPN_01323 
 KP1_2393 
   KPR_2379 
 Kvar_2974 
 vasE/tssK   A225_3378 
 KOX_22525 
 KPK_3067 
   N559_2929 
 KPN2242_09760 
   A79E_2838 
 KPHS_22990 
 KPN_01324 
 KP1_2395 
   KPR_2380 
 Kvar_2973 
 dotU/tssL   A225_3377 
 KOX_22520 
 KPK_3066 
   N559_2928 
 KPN2242_09765 
   A79E_2837 
 KPHS_23000 
 KPN_01325 
 KP1_2396 
   KPR_2381 
 Kvar_2972 
 ompA   A225_3376 
 KOX_22515 
 KPK_3065 
   N559_2927 
 KPN2242_09770 
   A79E_2836 
 KPHS_23010 
 KPN_01326 
 KP1_2397 
   KPR_2382 
 Kvar_2971 
 hcp/tssD   A225_3375 
 KOX_22510 
 KPK_3064 
   N559_2926 
 KPN2242_09775 
   A79E_2835 
 KPHS_23020 
 KPN_01327 
 KP1_2398 
   KPR_2383 
 Kvar_2970 
 clpV/tssH       KPK_3063 
   N559_2925 
 KPN2242_09780 
   A79E_2833 
 KPHS_23030 
 KPN_01328 
 KP1_2399 
   KPR_2384 
 Kvar_2969 
 vgrG/tssI   A225_3373 
 KOX_22495 
 KPK_3062 
   N559_2924 
 KPN2242_09785 
   A79E_2832 
 KPHS_23040 
 KPN_01329 
 KP1_2400 
   KPR_2385 
 Kvar_2968 
 -       KPK_3061 
   N559_2923 
 KPN2242_09790 
     KPHS_23050 
       KPR_2386 
 Kvar_2967 
 tli1       KPK_3060 
   N559_2922 
 KPN2242_09795 
     KPHS_23060 
       KPR_2387 
 Kvar_2966 
 tle1       KPK_3057 
   N559_2918 
 KPN2242_09810 
     KPHS_23105 
         Kvar_2961 
 -           N559_2917 
 KPN2242_09815 
     KPHS_23120 
         Kvar_2960 
 -           N559_2916 
 KPN2242_09820 
     KPHS_23130 
         Kvar_2959 
 icmF/tssM   A225_3362 
 KOX_22425 
     N559_2915 
 KPN2242_09825 
   A79E_2824 
 KPHS_23140 
 KPN_01342 
 KP1_2413 
     Kvar_2958 
 impA/tssA           N559_2914 
 KPN2242_09830 
   A79E_2823 
 KPHS_23150 
 KPN_01343 
 KP1_2414 
     Kvar_2957 
 tssF   A225_3360 
 KOX_22410 
     N559_2912 
 KPN2242_09835 
   A79E_2821 
 KPHS_23170 
 KPN_01347 
 KP1_2419 
     Kvar_2956 
 tssG   A225_3359 
 KOX_22405 
     N559_2911 
 KPN2242_09840 
   A79E_2820 
 KPHS_23180 
   KP1_2420 
     Kvar_2955 
 sciN/tssJ   A225_3358 
 KOX_22400 
     N559_2910 
 KPN2242_09845 
   A79E_2819 
 KPHS_23190 
   KP1_2421 
     Kvar_2954 
 T6SS-II   impF       KPK_0935 
             KPN_03181 
       
 sciN       KPK_0936 
                     
 impH       KPK_0937 
             KPN_03180 
       
 vasA/impG   A225_2640 
   KPK_0938 
             KPN_03179 
       
 icmF   A225_2638 
   KPK_0939 
             KPN_03175 
       
 vgrG   A225_2635 
   KPK_0944 
             KPN_03170 
       
 ompA   A225_2630 
   KPK_0945 
             KPN_03169 
     KPR_4181 
 
 dotU   A225_2629 
   KPK_0946 
                   KPR_4180 
 
 impJ       KPK_0947 
             KPN_03168 
     KPR_4179 
 
 clpV   A225_4443 
 KOX_00005 
 KPK_1206 
   N559_1341 
     A79E_1186 
 KPHS_39850 
 KPN_02915 
 KP1_4170 
   KPR_1358 
 Kvar_1151 
 T6SS-III   -       KPK_2040 
   N559_1999 
     A79E_1964 
 KPHS_32780 
 KPN_02276 
 KP1_3388 
     
 impJ   A225_4108 
 KOX_26045 
 KPK_2041 
   N559_2000 
 KPN2242_14320 
   A79E_1965 
 KPHS_32770 
 KPN_02275 
 KP1_3387 
   KPR_3184 
 
 dotU   A225_4107 
 KOX_26040 
 KPK_2042 
   N559_2001 
 KPN2242_14315 
   A79E_1966 
 KPHS_32760 
   KP1_3386 
   KPR_3183 
 
 ompA   A225_4106 
 KOX_26035 
 KPK_2043 
   N559_2002 
 KPN2242_14310 
   A79E_1967 
 KPHS_32750 
 KPN_02274 
 KP1_3385 
   KPR_3182 
 
 -       KPK_2045 
   N559_2003 
       KPHS_32740 
   KP1_3384 
     
 vgrG   A225_4101 
 KOX_26005 
 KPK_2046 
   N559_2004 
 KPN2242_14300 
   A79E_1968 
 KPHS_32730 
 KPN_02273 
 KP1_3383 
     
 lysM       KPK_2047 
                     
 -       KPK_2049 
     KPN2242_14290 
               
 -       KPK_2050 
                     
 -       KPK_2051 
     KPN2242_14270 
               
 icmF   A225_4098 
 KOX_25975 
 KPK_2052 
     KPN2242_14265 
   A79E_1983 
 KPHS_32500 
 KPN_02251 
 KP1_3370 
   KPR_3172 
 
 impG   A225_4094 
 KOX_25955 
 KPK_2053 
   N559_2027 
 KPN2242_14260 
   A79E_1984 
 KPHS_32490 
 KPN_02250 
 KP1_3369 
   KPR_3171 
 
 impH   A225_4093 
 KOX_25950 
 KPK_2054 
   N559_2028 
 KPN2242_14255 
   A79E_1985 
 KPHS_32480 
 KPN_02249 
 KP1_3368 
   KPR_3170 
 
 sciN   A225_4092 
 KOX_25945 
 KPK_2055 
   N559_2029 
 KPN2242_14250 
   A79E_1986 
 KPHS_32470 
 KPN_02248 
 KP1_3367 
   KPR_3169 
 
 impF   A225_2643 
 KOX_18870 
 KPK_2056 
   N559_2030 
 KPN2242_14245 
   A79E_1987 
 KPHS_32460 
   KP1_3366 
   KPR_3168 
 Kvar_1935 
 impA   A225_2644 
 KOX_18875 
 KPK_2057 
   N559_2031 
 KPN2242_14240 
   A79E_1988 
 KPHS_32450 
 KPN_02247 
 KP1_3364 
   KPR_3167 
 Kvar_1936 
 -       KPK_2058 
   N559_2032 
 KPN2242_14235 
   A79E_1989 
 KPHS_32440 
 KPN_02245 
 KP1_3363 
   KPR_3166 
 Kvar_1937 
 -       KPK_2059 
   N559_2033 
 KPN2242_14230 
   A79E_1990 
 KPHS_32430 
 KPN_02244 
 KP1_3362 
   KPR_3165 
 Kvar_1938 
Exotoxin
 Colibactin   clbA                 A79E_1662 
           
 clbB                 A79E_1663 
           
 clbC                 A79E_1664 
           
 clbD                 A79E_1665 
           
 clbE                 A79E_1666 
           
 clbF                 A79E_1667 
           
 clbG                 A79E_1668 
           
 clbH                 A79E_1669 
           
 clbI                 A79E_1670 
           
 clbJ                 A79E_1671 
           
 clbK                 A79E_1672 
           
 clbL                 A79E_1673 
           
 clbM                 A79E_1674 
           
 clbN                 A79E_1675 
           
 clbO                 A79E_1676 
           
 clbP                 A79E_1677 
           
 clbQ                 A79E_1678 
           
 clbS                 A79E_1679 
           
Immune modulation
 Capsule   -   A225_3877 
 KOX_25120 
 KPK_1651 
   N559_1747 
 KPN2242_15535 
   A79E_1611 
 KPHS_35540 
 KPN_02493 
 KP1_3701 
   KPR_1584 
 Kvar_1548 
 LPS   -   A225_3866 
 KOX_25070 
 KPK_1675 
   N559_1767 
 KPN2242_15475 
   A79E_1620 
 KPHS_35440 
 KPN_02483 
 KP1_3691 
   KPR_1604 
 Kvar_1565 
Biofilm
 Type 3 fimbriae   mrkH   A225_4832 
 KOX_01825 
 KPK_0839 
   N559_0963 
 KPN2242_19320 
   A79E_0833 
 KPHS_43400 
   KP1_4551 
   KPR_1757 
 Kvar_0797 
 mrkI   A225_4833 
 KOX_01830 
 KPK_0838 
   N559_0962 
 KPN2242_19325 
   A79E_0832 
 KPHS_43410 
 KPN_03273 
 KP1_4552 
   KPR_1756 
 Kvar_0796 
 mrkJ   A225_4834 
   KPK_0837 
   N559_0961 
 KPN2242_19330 
   A79E_0831 
 KPHS_43420 
 KPN_03274 
 KP1_4554 
   KPR_1755 
 Kvar_0795 
 mrkF   A225_4835 
 KOX_01845 
 KPK_0836 
   N559_0960 
 KPN2242_19335 
   A79E_0830 
 KPHS_43430 
 KPN_03275 
 KP1_4555 
   KPR_1754 
 Kvar_0794 
 mrkD   A225_4836 
 KOX_01850 
 KPK_0835 
   N559_0959 
 KPN2242_19340 
   A79E_0829 
 KPHS_43440 
 KPN_03276 
 KP1_4557 
   KPR_1753 
 Kvar_0793 
 mrkC   A225_4837 
 KOX_01855 
 KPK_0834 
   N559_0958 
 KPN2242_19345 
   A79E_0828 
 KPHS_43450 
 KPN_03277 
 KP1_4558 
   KPR_1751 
 Kvar_0792 
 mrkB   A225_4838 
 KOX_01860 
 KPK_0833 
   N559_0957 
 KPN2242_19350 
   A79E_0827 
 KPHS_43460 
 KPN_03278 
 KP1_4560 
   KPR_1750 
 Kvar_0791 
 mrkA   A225_4839 
 KOX_01865 
 KPK_0832 
   N559_0956 
 KPN2242_19355 
   A79E_0826 
 KPHS_43470 
 KPN_03279 
 KP1_4561 
   KPR_1749 
 Kvar_0790 
Nutritional/Metabolic factor
 Aerobactin   iucA               KPN2242_25281 
         pK2044_01340 
 KPR_4897 
 
 iucB               KPN2242_25276 
         pK2044_01335 
 KPR_4896 
 
 iucC               KPN2242_25271 
         pK2044_01330 
 KPR_4895 
 
 iucD               KPN2242_25266 
         pK2044_01325 
 KPR_4894 
 
 iutA   A225_2329 
 KOX_17385 
 KPK_3447 
   N559_3180 
 KPN2242_08605 
   A79E_3122 
 KPHS_19870 
 KPN_01108 
 KP1_2101 
   KPR_4893 
 Kvar_3272 
 Allantion utilization   allS                 A79E_3804 
     KP1_1357 
     
 allA                 A79E_3803 
     KP1_1359 
     
 allR                 A79E_3802 
     KP1_1360 
     
 allB                 A79E_3795 
     KP1_1367 
     
 allC                 A79E_3791 
     KP1_1372 
     
 allD                 A79E_3790 
     KP1_1373 
     
 Ent 
(Enterobactin) 
 entA   A225_1611 
 KOX_13965 
 KPK_3964 
   N559_3713 
 KPN2242_05930 
   A79E_3626 
 KPHS_14490 
 KPN_00614 
 KP1_1560 
     Kvar_3754 
 entB   A225_1610 
 KOX_13960 
 KPK_3965 
   N559_3714 
 KPN2242_05925 
   A79E_3627 
 KPHS_14480 
 KPN_00613 
 KP1_1559 
     Kvar_3755 
 entE   A225_1609 
 KOX_13955 
 KPK_3966 
   N559_3715 
 KPN2242_05920 
   A79E_3628 
 KPHS_14470 
 KPN_00612 
 KP1_1558 
     Kvar_3756 
 entC   A225_1608 
 KOX_13950 
 KPK_3967 
   N559_3716 
 KPN2242_05915 
   A79E_3629 
 KPHS_14460 
 KPN_00611 
 KP1_1557 
     Kvar_3757 
 fepB   A225_1607 
 KOX_13945 
 KPK_3968 
   N559_3717 
 KPN2242_05910 
   A79E_3630 
 KPHS_14450 
 KPN_00610 
 KP1_1556 
     Kvar_3758 
 entS   A225_1604 
 KOX_13925 
 KPK_3969 
   N559_3718 
 KPN2242_05905 
   A79E_3631 
 KPHS_14440 
 KPN_00609 
 KP1_1555 
     Kvar_3759 
 fepD   A225_1603 
 KOX_13920 
 KPK_3970 
     KPN2242_05900 
   A79E_3632 
 KPHS_14430 
 KPN_00608 
 KP1_1553 
     Kvar_3760 
 fepG   A225_1602 
 KOX_13915 
 KPK_3971 
   N559_3719 
 KPN2242_05895 
   A79E_3633 
 KPHS_14420 
 KPN_00607 
 KP1_1552 
     Kvar_3761 
 fepC   A225_1601 
 KOX_13910 
 KPK_3972 
   N559_3720 
 KPN2242_05890 
   A79E_3634 
 KPHS_14410 
 KPN_00606 
 KP1_1551 
     Kvar_3762 
 entF   A225_1600 
 KOX_13905 
 KPK_3973 
   N559_3721 
 KPN2242_05885 
   A79E_3635 
 KPHS_14400 
 KPN_00605 
 KP1_1550 
     Kvar_3763 
 fes   A225_1598 
 KOX_13895 
 KPK_3975 
   N559_3723 
 KPN2242_05875 
   A79E_3637 
 KPHS_14380 
 KPN_00603 
 KP1_1548 
     Kvar_3765 
 fepA   A225_1597 
 KOX_13890 
 KPK_3976 
   N559_3724 
 KPN2242_05870 
   A79E_3638 
 KPHS_14370 
 KPN_00602 
 KP1_1547 
     Kvar_3766 
 entD   A225_1596 
 KOX_13885 
 KPK_3977 
   N559_3725 
 KPN2242_05865 
   A79E_3639 
 KPHS_14360 
 KPN_00601 
 KP1_1546 
     Kvar_3767 
 Sal 
(Salmochelin) 
 iroE   A225_3752 
 KOX_24260 
 KPK_2690 
   N559_2629 
 KPN2242_11295 
   A79E_2547 
 KPHS_26150 
 KPN_01678 
 KP1_2725 
   KPR_2579 
 Kvar_2645 
 iroN     KOX_18265 
 KPK_3197 
   N559_3036 
 KPN2242_09340 
   A79E_2942 
 KPHS_21440 
 KPN_01244 
 KP1_3609 
   KPR_2293 
 
 iroB                 A79E_1750 
     KP1_3611 
     
 iroC                       KP1_3612 
   KPR_1714 
 
 iroD                 A79E_1751 
     KP1_3613 
   KPR_1713 
 
 Ybt 
(Yersiniabactin) 
 ybtS   A225_2987 
 KOX_20605 
           A79E_1711 
 KPHS_34610 
   KP1_3583 
     
 ybtX   A225_2988 
 KOX_20610 
           A79E_1710 
 KPHS_34620 
   KP1_3584 
     
 ybtQ   A225_2989 
 KOX_20615 
           A79E_1709 
 KPHS_34630 
   KP1_3585 
     
 ybtP   A225_2990 
 KOX_20620 
           A79E_1708 
 KPHS_34640 
   KP1_3586 
     
 ybtA   A225_2991 
 KOX_20625 
           A79E_1707 
 KPHS_34650 
   KP1_3587 
     
 irp2   A225_2992 
 KOX_20630 
           A79E_1706 
 KPHS_34660 
   KP1_3588 
     
 irp1   A225_2993 
             A79E_1705 
 KPHS_34670 
   KP1_3589 
     
 ybtU   A225_2994 
 KOX_20645 
           A79E_1704 
 KPHS_34680 
   KP1_3590 
     
 ybtT   A225_2995 
 KOX_20650 
           A79E_1703 
 KPHS_34690 
   KP1_3591 
     
 ybtE   A225_2996 
 KOX_20655 
           A79E_1702 
 KPHS_34700 
   KP1_3592 
     
 fyuA   A225_2997 
 KOX_20660 
           A79E_1701 
 KPHS_34710 
   KP1_3593 
     
Antimicrobial activity/Competitive advantage
 AcrAB   acrA   A225_1327 
 KOX_12990 
 KPK_4236 
   N559_3957 
 KPN2242_04625 
   A79E_3836 
 KPHS_11890 
 KPN_00444 
 KP1_1320 
   KPR_4198 
 Kvar_3937 
 acrB   A225_1326 
 KOX_12985 
 KPK_4237 
   N559_3958 
 KPN2242_04620 
   A79E_3837 
 KPHS_11880 
 KPN_00443 
 KP1_1319 
   KPR_4195 
 Kvar_3938 
Regulation
 RcsAB 
(Regulation of capsule synthesis) 
 rcsA   A225_3729 
 KOX_24155 
 KPK_1859 
   N559_1838 
 KPN2242_15070 
   A79E_1810 
 KPHS_34420 
 KPN_02421 
 KP1_3552 
   KPR_3371 
 Kvar_1686 
 rcsB   A225_4123 
 KOX_26115 
 KPK_1513 
   N559_1616 
 KPN2242_16255 
   A79E_1465 
 KPHS_37040 
 KPN_02638 
 KP1_3872 
   KPR_2075 
 Kvar_1415 
 RmpA 
(Regulator of mucoid phenotype A) 
 rmpA               KPN2242_26191 
       KP1_3619 
   KPR_1710* 
 
 rmpA2         HS323_RS00305 
                   
Download current table as
EXCEL file
or
TEXT file
Back to top
Last update: Thu Sep 13 13:36:54 2018
2004-2021 IPB, CAMS&PUMC