Comparison of pathogenomic composition of Helicobacter. Total 8 genomes available.
 Virulence factors   Related genes   H. acinonychis str. Sheeba   H. hepaticus ATCC 51449   H. pylori 26695   H. pylori G27   H. pylori HPAG1   H. pylori J99   H. pylori P12   H. pylori Shi470 
 chromosome 
 NC_008229 
 chromosome 
 NC_004917 
 chromosome 
 NC_000915 
 chromosome 
 NC_011333 
 chromosome 
 NC_008086 
 chromosome 
 NC_000921 
 chromosome 
 NC_011498 
 chromosome 
 NC_010698 
Acid resistance
 Urease   ureA   Hac_1532 
 HH0407 
 HP0073 
 HPG27_68 
 HPAG1_0074 
 jhp0068 
 HPP12_0077 
 HPSH_00355 
 ureB   Hac_1533 
 HH0408 
 HP0072 
 HPG27_67 
 HPAG1_0073 
 jhp0067 
 HPP12_0076 
 HPSH_00350 
 ureI   Hac_1534 
 HH0409 
 HP0071 
 HPG27_66 
 HPAG1_0072 
 jhp0066 
 HPP12_0075 
 HPSH_00340 
 ureE   Hac_1535 
 HH0410 
 HP0070 
 HPG27_65 
 HPAG1_0071 
 jhp0065 
 HPP12_0074 
 HPSH_00335 
 ureF   Hac_1536 
 HH0411 
 HP0069 
 HPG27_64* 
 HPAG1_0070 
 jhp0064 
 HPP12_0073 
 HPSH_00330 
 ureG   Hac_1537 
 HH0412 
 HP0068 
 HPG27_63 
 HPAG1_0069 
 jhp0063 
 HPP12_0072 
 HPSH_00325 
 ureH   Hac_1538 
 HH0413 
 HP0067 
 HPG27_62 
 HPAG1_0068 
 jhp0062 
 HPP12_0071 
 HPSH_00320 
Adherence
 adherence-associated lipoprotein AlpA (hopC)   alpA/hopC   Hac_1300 
   HP0912 
 HPG27_863 
 HPAG1_0895 
 jhp0848 
 HPP12_0910 
 HPSH_04805 
 AlpB (hopB)   alpB/hopB   Hac_1301 
   HP0913 
 HPG27_864 
 HPAG1_0896 
 jhp0849 
 HPP12_0911 
 HPSH_04810 
 Blood group antigen binding adhesins   babA/hopS       HP1243 
 HPG27_298 
 HPAG1_0876 
 jhp0833 
 HPP12_0891 
 HPSH_04720 
 babB/hopT       HP0896 
 HPG27_1187 
 HPAG1_0320 
 jhp1164 
 HPP12_1209 
 HPSH_06440 
 H. pylori adhesin A   hpaA   Hac_0919 
   HP0797 
 HPG27_753 
 HPAG1_0782 
 jhp0733 
 HPP12_0804 
 HPSH_02830 
 HopZ   hopZ       HP0009 
 HPG27_8 
 HPAG1_0009 
 jhp0007 
 HPP12_0007 
 
 HorB   horB   Hac_1453 
   HP0127 
 HPG27_116 
 HPAG1_0126 
 jhp0117 
 HPP12_0127 
 HPSH_00635 
 PEB1   peb1     HH1481 
           
 Sialic acid binding adhesins   sabA/hopP   Hac_0946* 
   HP0725 
 HPG27_680 
 HPAG1_0709 
 jhp0662 
   
 sabB/hopO       HP0722 
 HPG27_677 
 HPAG1_0706 
 jhp0659 
 HPP12_0730 
 HPP12_0733 
 
Immune evasion
 Lipopolysaccharide Lewis antigens   futA   Hac_0481* 
 HH1776 
 HP0379 
 HPG27_1018 
 HPAG1_0636 
 jhp1002 
 HPP12_1042 
 HPSH_05520 
 futB   Hac_1063 
   HP0651 
 HPG27_613 
 HPAG1_1013 
 jhp0596 
 HPP12_0664 
 
 futC   Hac_1510* 
 HH0069* 
 HP0093* 
 HPG27_86* 
 HPAG1_0094 
 jhp0086 
 HPP12_0096 
 HPSH_00470 
Immune modulator
 Neutrophil-activating protein (HP-NAP)   napA   Hac_1375 
 HH0210 
 HP0243 
 HPG27_223 
 HPAG1_0246 
 jhp0228 
 HPP12_0243 
 HPSH_01265 
 Outer inflammatory protein   oipA/hopH   Hac_0752* 
   HP0638 
 HPG27_599 
 HPAG1_0621 
 jhp0581 
 HPP12_0650 
 HPSH_03300 
Motility
 Flagella   flaA   Hac_1403 
 HH1653 
 HH1364 
 HP0601 
 HPG27_562 
 HPAG1_0582 
 jhp0548 
 HPP12_0609 
 HPSH_03855 
 flaB   Hac_1474 
 HH1796 
 HP0115 
 HPG27_107 
 HPAG1_0115 
 jhp0107 
 HPP12_0117 
 HPSH_00580 
 flaG   Hac_0667 
 HH0789 
 HP0751 
 HPG27_708 
 HPAG1_0736 
 jhp0688 
 HPP12_0761 
 HPSH_03075 
 fliR   Hac_0353 
 HH0704 
 HP0173 
 HPG27_158 
 HPAG1_0169 
 jhp0159 
 HPP12_0170 
 HPSH_00870 
 flgI   Hac_1371 
 HH0142 
 HP0246 
 HPG27_226 
 HPAG1_0249 
 jhp0231 
 HPP12_0246 
 HPSH_01280 
 flgL   Hac_0555 
 HH1695 
 HP0295 
 HPG27_274 
 HPAG1_0297 
 jhp0280 
 HPP12_0294 
 HPSH_01530 
 flgH   Hac_0996 
 HH0899 
 HP0325 
 HPG27_306 
 HPAG1_0328 
 jhp0308 
 HPP12_0322 
 HPSH_01685 
 -   Hac_0993 
   HP0327 
 HPG27_309 
 HPAG1_0331 
 jhp0310 
 HPP12_0325 
 HPSH_01700 
 fliF   Hac_0971 
 HH0611 
 HP0351 
 HPG27_328 
 HPAG1_0346 
 jhp0325 
 HPP12_0345 
 HPSH_01815 
 fliG   Hac_0970 
 HH0610 
 HP0352 
 HPG27_329 
 HPAG1_0347 
 jhp0326 
 HPP12_0346 
 HPSH_01820 
 fliH   Hac_0969 
 HH0609 
 HP0353 
 HPG27_330 
 HPAG1_0348 
 jhp0327 
 HPP12_0347 
 HPSH_01825 
 flgG_1   Hac_0788 
 HH1090 
 HP1092 
 HPG27_337 
 HPAG1_0355 
 jhp0333 
 HPP12_0352 
 HPSH_01850 
 flhA   Hac_1145 
 HH0467 
 HP1041 
 HPG27_387 
 HPAG1_0406 
 jhp0383 
 HPP12_0403 
 HPSH_02110 
 flhF   Hac_1139 
 HH1143 
 HP1035 
 HPG27_393 
 HPAG1_0412 
 jhp0389 
 HPP12_0409 
 HPSH_02140 
 fliA   Hac_1136 
 HH1146 
 HP1032 
 HPG27_396 
 HPAG1_0415 
 jhp0392 
 HPP12_0412 
 HPSH_02155 
 fliM   Hac_1135 
 HH1147 
 HP1031 
 HPG27_397 
 HPAG1_0416 
 jhp0393 
 HPP12_0413 
 HPSH_02160 
 fliY   Hac_1134 
 HH1148 
 HP1030 
 HPG27_398 
 HPAG1_0417 
 jhp0394 
 HPP12_0414 
 HPSH_02165 
 fliN   Hac_1428 
 HH1577 
 HP0584 
 HPG27_543 
 HPAG1_0563 
 jhp0531 
 HPP12_0590 
 HPSH_03955 
 fliP   Hac_0864 
 HH0692 
 HP0685 
 HPG27_642 
 HPAG1_0668 
 jhp0625 
 HPP12_0697 
 HPSH_03440 
 fliD   Hac_0666 
 HH0790 
 HP0752 
 HPG27_709 
 HPAG1_0737 
 jhp0689 
 HPP12_0762 
 HPSH_03070 
 fliS   Hac_0665 
 HH0791 
 HP0753 
 HPG27_710 
 HPAG1_0738 
 jhp0690 
 HPP12_0763 
 HPSH_03065 
 flhB_1   Hac_0645 
 HH1018 
 HP0770 
 HPG27_727 
 HPAG1_0755 
 jhp0707 
 HPP12_0779 
 
 fliL   Hac_0829 
 HH1554 
 HP0809 
 HPG27_765 
 HPAG1_0794 
 jhp0745 
 HPP12_0815 
 HPSH_02770 
 motA   Hac_0718 
 HH0501 
 HP0815 
 HPG27_771 
 HPAG1_0800 
 jhp0751 
 HPP12_0821 
 HPSH_02735 
 motB   Hac_0719 
 HH0502 
 HP0816 
 HPG27_772 
 HPAG1_0801 
 jhp0752 
 HPP12_0822 
 HPSH_02730 
 flgE_1   Hac_1233 
 HH1704 
 HP0870 
 HPG27_824 
 HPAG1_0853 
 jhp0804 
 HPP12_0870 
 HPSH_02460 
 flgD   Hac_1294 
 HH0184 
 HP0907 
 HPG27_858 
 HPAG1_0889 
 jhp0843 
 HPP12_0905 
 HPSH_04775 
 flgE_2   Hac_1295 
 HH0183 
 HP0908 
 HPG27_859 
 HPAG1_0890 
 jhp0844 
 HPP12_0906 
 HPSH_04780 
 flgK   Hac_0597 
 HH0876 
 HP1119 
 HPG27_1064 
 HPAG1_1057 
 jhp1047 
 HPP12_1084 
 HPSH_05760 
 pflA   Hac_0210 
 HH1589 
 HP1274 
 HPG27_1219 
 HPAG1_1218 
 jhp1195 
 HPP12_1240 
 HPSH_06600 
 fliQ   Hac_0105 
 HH0438 
 HP1419 
 HPG27_1342 
 HPAG1_1345 
 jhp1314 
 HPP12_1392 
 HPSH_07240 
 fliI   Hac_0106 
 HH0565 
 HP1420 
 HPG27_1343 
 HPAG1_1346 
 jhp1315 
 HPP12_1393 
 HPSH_07245 
 flgA   Hac_1737 
   HP1477 
 HPG27_1400 
 HPAG1_1436 
 jhp1370 
 HPP12_1455 
 HPSH_07570 
 fliE   Hac_1665 
 HH1409 
 HP1557 
 HPG27_1495 
 HPAG1_1506 
 jhp1465 
 HPP12_1549 
 HPSH_08115 
 flgC   Hac_1666 
 HH1408 
 HP1558 
 HPG27_1496 
 HPAG1_1507 
 jhp1466 
 HPP12_1550 
 HPSH_08120 
 flgB   Hac_1667 
 HH1407 
 HP1559 
 HPG27_1497 
 HPAG1_1508 
 jhp1467 
 HPP12_1551 
 HPSH_08125 
 flhB_2   Hac_1682 
 HH1320 
 HP1575 
 HPG27_1512 
 HPAG1_1524 
 jhp1483 
 HPP12_1566 
 HPSH_08205 
 flgG_2   Hac_0252 
 HH1081 
 HP1585 
 HPG27_1523 
 HPAG1_1533 
 jhp1492 
 HPP12_1576 
 HPSH_08250 
Secretion system
 Cag PAI type IV secretion system   cag1       HP0520 
 HPG27_479 
 HPAG1_0495 
 jhp0469 
 HPP12_0527 
 HPSH_04325 
 cag2       HP0521* 
 HPG27_480 
 HPAG1_0496* 
 jhp0470 
 HPP12_0528 
 
 cag3       HP0522 
 HPG27_481 
 HPAG1_0497 
 jhp0471 
 HPP12_0529 
 HPSH_04315 
 cag4       HP0523 
 HPG27_482 
 HPAG1_0498 
 jhp0472 
 HPP12_0530 
 HPSH_04310 
 cag5       HP0524 
 HPG27_483 
 HPAG1_0499 
 jhp0473 
 HPP12_0531 
 HPSH_04305 
 virB11       HP0525 
 HPG27_484 
 HPAG1_0500 
 jhp0474 
 HPP12_0532 
 HPSH_04300 
 cagZ       HP0526 
 HPG27_485 
 HPAG1_0501 
 jhp0475 
 HPP12_0533 
 HPSH_04295 
 cagY       HP0527 
 HPG27_486* 
 HPAG1_0502 
 jhp0476 
 HPP12_0534 
 HPSH_04285 
 cagX       HP0528 
 HPG27_487 
 HPAG1_0504 
 jhp0477 
 HPP12_0535 
 HPSH_04280 
 cagW       HP0529 
 HPG27_488 
 HPAG1_0505 
 jhp0478 
 HPP12_0536 
 HPSH_04275 
 cagV       HP0530 
 HPG27_489 
 HPAG1_0506 
 jhp0479 
 HPP12_0537 
 HPSH_04270 
 cagU       HP0531 
 HPG27_490 
 HPAG1_0507 
 jhp0480 
 HPP12_0538 
 HPSH_04265 
 cagT       HP0532 
 HPG27_491 
 HPAG1_0508 
 jhp0481 
 HPP12_0539 
 HPSH_04260 
 cagS       HP0534 
 HPG27_492 
 HPAG1_0510 
 jhp0482 
 HPP12_0540 
 HPSH_04255 
 cagQ       HP0535 
 HPG27_493 
 HPAG1_0511 
 jhp0483 
 HPP12_0541 
 HPSH_04240 
 cagP       HP0536 
     jhp0484 
 HPP12_0543 
 HPSH_04210 
 cagM       HP0537 
 HPG27_495 
 HPAG1_0512 
 jhp0485 
 HPP12_0544 
 HPSH_04205 
 cagN       HP0538 
 HPG27_496 
 HPAG1_0513 
 jhp0486 
 HPP12_0545 
 HPSH_04200 
 cagL       HP0539 
 HPG27_497 
 HPAG1_0514 
 jhp0487 
 HPP12_0546 
 HPSH_04195 
 cagI       HP0540 
 HPG27_498 
 HPAG1_0515 
 jhp0488 
 HPP12_0547 
 HPSH_04190 
 cagH       HP0541 
 HPG27_499 
 HPAG1_0516 
 jhp0489 
 HPP12_0548 
 HPSH_04185 
 cagG       HP0542 
 HPG27_501 
 HPAG1_0517 
 jhp0490 
 HPP12_0549 
 HPSH_04175 
 cagF       HP0543 
 HPG27_502 
 HPAG1_0518 
 jhp0491 
 HPP12_0550 
 HPSH_04170 
 cagE       HP0544 
 HPG27_503 
 HPAG1_0520 
 jhp0492 
 HPP12_0551 
 HPSH_04165 
 cagD       HP0545 
 HPG27_504 
 HPAG1_0521 
 jhp0493 
 HPP12_0552 
 HPSH_04160 
 cagC       HP0546 
 HPG27_505 
 HPAG1_0522 
 jhp0494 
 HPP12_0553 
 HPSH_04155 
 T4SS effectors cytotoxin-associated gene A   cagA       HP0547 
 HPG27_507 
 HPAG1_0524 
 jhp0495 
 HPP12_0555 
 HPSH_04145 
Toxin
 Cytolethal distending toxin   cdtA     HH1446 
           
 cdtB     HH1447 
           
 cdtC     HH1448 
           
 Vacuolating cytotoxin   vacA   Hac_1253-66* 
 Hac_0502-15* 
   HP0887 
 HPG27_840 
 HPAG1_0867 
 jhp0819 
 HPP12_0884 
 HPSH_04675 
Others
 DupA (duodenal ulcer promoting)   dupA         HPG27_963* 
   jhp0917-8* 
   HPSH_04615 
 Plasticity region   -             jhp0947 
 HPP12_0441 
 
 -             jhp0948 
 HPP12_0440 
 
 -             jhp0949 
 HPP12_0439 
 
Download current table as
EXCEL file
TEXT file
Last update: Wed Dec 19 14:54:04 2018