Comparison of pathogenomic composition of Haemophilus. Total 7 genomes available.
 Virulence factors   Related genes   H. ducreyi 35000HP   H. influenzae 86-028NP (non-typeable)   H. influenzae PittEE (nontypeable)   H. influenzae PittGG (nontypeable)   H. influenzae Rd KW20 (serotype d)   H. somnus 129PT   H. somnus 2336 
 chromosome 
 NC_002940 
 chromosome 
 NC_007146 
 chromosome 
 NC_009566 
 chromosome 
 NC_009567 
 chromosome 
 NC_000907 
 chromosome 
 NC_008309 
 chromosome 
 NC_010519 
Adherence
 Haemagglutinating pili   hifA         CGSHiGG_10025 
     
 hifB         CGSHiGG_10030 
     
 hifC         CGSHiGG_10035 
     
 hifD         CGSHiGG_10040 
     
 hifE         CGSHiGG_10045 
     
 Haemophilus adhesion and penetration (Hap)   hap     NTHI0354 
         
 Hia/Hsf   hia/hsf         CGSHiGG_02400 
 HI1731a 
   
 HMW1   hmw1A     NTHI1983 
 CGSHiEE_03650 
       
 hmw1B     NTHI1984 
 CGSHiEE_03645 
       
 hmw1C   HD1895 
 NTHI1985 
 CGSHiEE_03640 
       
 HMW2   hmw2A     NTHI1450 
 CGSHiEE_05600 
       
 hmw2B     NTHI1449 
 CGSHiEE_05605 
       
 hmw2C     NTHI1448 
 CGSHiEE_05610 
       
 OapA   oapA   HD0651 
 NTHI0448 
 CGSHiEE_01380 
 CGSHiGG_04450 
 HI0330 
 HS_1287 
 HSM_0331 
 P5 protein   ompP5   HD0045 
 HD0046 
 NTHI1332 
 CGSHiEE_06225 
   HI1164 
 HS_1035 
 HSM_1513 
 The tad locus   flp1   HD1312 
           
 flp2   HD1311 
           
 flp3   HD1310 
           
 flpB   HD1309 
           
 flpC   HD1308 
           
 rcpA   HD1307 
           
 rcpB   HD1306 
           
 flpD   HD1305 
           
 tadA   HD1304 
           
 tadB   HD1303 
           
 tadC   HD1302 
           
 tadD   HD1301 
           
 tadE   HD1300 
           
 tadF   HD1299 
           
 tadG   HD1298 
           
 Type IV pili   pilA   HD1123 
 NTHI0409 
 CGSHiEE_01560 
 CGSHiGG_04310 
 HI0299 
 HS_0250 
 HSM_0123 
 pilB   HD1124 
 NTHI0408 
 CGSHiEE_01565 
 CGSHiGG_04305 
 HI0298 
 HS_1430 
 HSM_0217 
 pilC   HD1125 
 NTHI0407 
 CGSHiEE_01570 
 CGSHiGG_04300 
 HI0297 
 HS_0457 
 HSM_0755 
 pilD   HD1126 
 NTHI0406 
 CGSHiEE_01575 
 CGSHiGG_04295 
 HI0296 
 HS_0458 
 HSM_0756 
 comE/pilQ   HD0434 
 NTHI0560 
 CGSHiEE_00815 
 CGSHiGG_05395 
 HI0435 
 HS_1112 
 HSM_1067 
Endotoxin
 LOS   kdsB   HD0334 
 NTHI0068 
 CGSHiEE_03010 
 CGSHiGG_02800 
 HI0058 
 HS_0658 
 HSM_0998 
 lpxK   HD0217 
 NTHI0069 
 CGSHiEE_03005 
 CGSHiGG_02805 
 HI0059 
 HS_0656 
 HSM_0996 
 msbA   HD1630 
 NTHI0072 
 CGSHiEE_03000 
 CGSHiGG_02810 
 HI0060 
 HS_1021 
 HSM_1499 
 msbB   HD0404 
 NTHI0296 
 CGSHiEE_02255 
 CGSHiGG_03610 
 HI0199 
 HS_1202 
 HSM_0361 
 lgtC   HD1090 
 NTHI0365 
 CGSHiEE_01770 
   HI0258 
 HS_0636 
 
 orfM   HD1348 
 NTHI0366 
 CGSHiEE_01765 
 CGSHiGG_04080 
 HI0260 
 HS_0125 
 HSM_2010 
 kdkA   HD1101 
 NTHI0367 
 CGSHiEE_01760 
 CGSHiGG_04085 
 HI0260.1 
   
 opsX/rfaC   HD0445 
 NTHI0368 
   CGSHiGG_04090 
 HI0261 
 HS_1611 
 HSM_0399 
 lpt6     NTHI0383 
 CGSHiEE_01675 
 CGSHiGG_04175 
 HI0275 
 HS_0234 
 HSM_0102 
 galE   HD0829 
 NTHI0471 
 CGSHiEE_01245 
 CGSHiGG_04565 
 HI0351 
 HS_0789 
 HSM_1256 
 lic3A     NTHI0472 
 NTHI1034 
 CGSHiEE_07715 
 CGSHiEE_01240 
 CGSHiGG_04570 
 CGSHiGG_07845 
 HI0352 
   
 waaQ   HD1202 
 NTHI0649 
   CGSHiGG_05865 
 HI0523 
   
 lic2A   HD0472 
 NTHI0677 
 CGSHiEE_00225 
 CGSHiGG_06005 
 HI0550 
 HS_0637 
 HSM_0978 
 HSM_0977 
 kdtA   HD0454 
 NTHI0772 
 CGSHiEE_08940 
 CGSHiGG_06540 
 HI0652 
 HS_1590 
 HSM_0421 
 lgtF   HD1201 
 NTHI0773 
 CGSHiEE_08935 
 CGSHiGG_06545 
 HI0653 
 HS_0291 
 HSM_0164 
 lpxH   HD1938 
 NTHI0892 
 CGSHiEE_08445 
 CGSHiGG_07140 
 HI0735 
 HS_0498 
 HSM_1773 
 yhxB/manB   HD1507 
 NTHI0899 
 CGSHiEE_08405 
 CGSHiGG_07190 
 HI0740 
 HS_1118 
 HS_1670 
 HSM_1832 
 lex2A     NTHI0910* 
 CGSHiEE_08335 
 CGSHiGG_07260 
     
 lex2B   HD1721 
 NTHI0913 
 CGSHiEE_08330 
 CGSHiGG_07265 
   HS_0638 
 HSM_0979 
 lpsA     NTHI0926 
 CGSHiEE_08265 
 CGSHiGG_07320 
 HI0765 
   
 galU   HD1431 
 NTHI0976 
 CGSHiEE_08000 
 CGSHiGG_07555 
 HI0812 
 HS_1117 
 HSM_1063 
 -       CGSHiEE_07700 
   HI0867 
   
 kfiC       CGSHiEE_07695 
 CGSHiGG_07875 
 HI0868 
   
 orfE       CGSHiEE_07690 
 CGSHiGG_07880 
 HI0869 
   
 orfO           HI0870 
   
 siaA   HD0686 
   CGSHiEE_07675 
 CGSHiGG_07890 
 HI0871 
   HSM_1426 
 wbaP/rfbP       CGSHiEE_07670 
 CGSHiGG_07895 
 HI0872 
   
 rffG   HD0687 
 NTHI1037 
 CGSHiEE_07665 
 CGSHiGG_07900 
 HI0873 
 HS_0707 
 HSM_1118 
 lpxD   HD1189 
 NTHI1082 
 CGSHiEE_07440 
 CGSHiGG_08135 
 HI0915 
 HS_0978 
 HSM_1456 
 yhbX   HD0371 
 NTHI1180 
   CGSHiGG_08625 
 HI1005 
   
 lpxB   HD0846 
 NTHI1220 
 CGSHiEE_06780 
 CGSHiGG_08930 
 HI1060 
 HS_1358 
 HSM_0257 
 lpxA   HD1187 
 NTHI1222 
 CGSHiEE_06775 
   HI1061 
 HS_1359 
 HSM_0256 
 -   HD1598 
 NTHI1224 
 CGSHiEE_06765 
 CGSHiGG_08950 
 HI1064 
   
 rfaF   HD0653 
 NTHI1272 
 CGSHiEE_06535 
 CGSHiGG_09175 
 HI1105 
 HS_1612 
 HSM_0398 
 rfaD   HD1890 
 NTHI1278 
 CGSHiEE_06480 
 CGSHiGG_09225 
 HI1114 
 HS_1613 
 HSM_0397 
 lpxC   HD0816 
 NTHI1312 
 CGSHiEE_06325 
 CGSHiGG_09380 
 HI1144 
 HS_0364 
 HSM_0634 
 gmhA/lpcA   HD1228 
 NTHI1350 
 CGSHiEE_06140 
 CGSHiGG_09600 
 HI1181 
 HS_1238 
 HSM_0840 
 neuA   HD0685 
 NTHI1891 
 CGSHiEE_04135 
 CGSHiGG_01585 
 HI1279 
 HS_0706 
 HSM_1117 
 rfaE   HD1182 
 NTHI1607 
 CGSHiEE_05200 
 CGSHiGG_00330 
 HI1526 
 HS_0576 
 HSM_0925 
 htrB   HD1106 
 NTHI1606 
   CGSHiGG_00325 
 HI1527 
 HS_0575 
 HSM_0924 
 licA   HD1021* 
 NTHI1597 
 CGSHiEE_05255 
 CGSHiGG_00280 
 CGSHiGG_00115 
 HI1537 
 HS_1461 
 HSM_0542 
 licB     NTHI1596 
 CGSHiEE_05260 
 CGSHiGG_00275 
 CGSHiGG_00110 
 HI1538 
 HS_1460 
 HSM_0543 
 licC     NTHI1595 
 CGSHiEE_05265 
 CGSHiGG_00270 
 CGSHiGG_00105 
 HI1539 
 HS_1459 
 HSM_0544 
 licD     NTHI1594 
   CGSHiGG_00265 
 CGSHiGG_00100 
 HI1540 
 HS_1458 
 HSM_0545 
 kdsA   HD0857 
 NTHI1576 
 CGSHiEE_05365 
 CGSHiGG_00170 
 HI1557 
 HS_0946 
 HSM_1421 
 lgtA   HD0466 
 NTHI1474 
   CGSHiGG_00020 
 HI1578 
 HS_0636a* 
 HSM_0975 
 kpsF   HD1168 
 NTHI1981 
 CGSHiEE_03670 
 CGSHiGG_02125 
 HI1678 
 HS_0918 
 HSM_1396 
 lsgF   HD0886 
 NTHI2002 
 CGSHiEE_03560 
 CGSHiGG_02215 
 HI1695 
   
 lsgE   HD0885 
 NTHI2003 
 CGSHiEE_03555 
   HI1696 
   
 lsgD   HD0883 
 NTHI2004 
 CGSHiEE_03550 
 CGSHiGG_02230 
 HI1697 
   
 lsgC     NTHI2005 
 CGSHiEE_03545 
 CGSHiGG_02235 
 HI1698 
   
 lsgB     NTHI2006 
   CGSHiGG_02245 
 HI1699 
   HSM_1794 
 lsgA   HD0882 
 NTHI2007 
 CGSHiEE_03530 
 CGSHiGG_02250 
 HI1700 
   
 wecA   HD1844 
 NTHI2025 
 CGSHiEE_03450 
 CGSHiGG_02330 
 HI1716 
   
Immune evasion
 Exopolysaccharide   mrsA/glmM   HD0201 
 NTHI1664 
 CGSHiEE_04920 
   HI1463 
 HS_0730 
 HSM_1197 
 galU   HD1431 
 NTHI0976 
 CGSHiEE_08000 
 CGSHiGG_07555 
 HI0812 
 HS_1117 
 HSM_1063 
 galE   HD0829 
 NTHI0471 
 CGSHiEE_01245 
 CGSHiGG_04565 
 HI0351 
 HS_0789 
 HSM_1256 
 pgi   HD0418 
 NTHI1475 
 CGSHiEE_05470 
 CGSHiGG_00035 
 HI1576 
 HS_0938 
 HSM_1413 
 manA   HD0765 
   CGSHiEE_03480* 
   HI1710* 
 HS_0605 
 HSM_0956 
 manB   HD1507 
 NTHI0899 
 CGSHiEE_08405 
 CGSHiGG_07190 
 HI0740 
 HS_1118 
 HS_1670 
 HSM_1062 
 HSM_1832 
 IgA1 protease   iga1     NTHI1164 
 CGSHiEE_07015 
   HI0990 
   
 P2 porin   ompP2   HD1435 
 HD1433 
 NTHI0225 
 CGSHiEE_02590 
 CGSHiGG_03275 
 HI0139 
   
Iron uptake
 Haemophilus iron transport locus   hitA     NTHI0177 
 CGSHiEE_02810 
 CGSHiGG_03025 
 HI0097 
 HS_0783 
 HSM_1250 
 hitB     NTHI0179 
     HI0098 
 HS_0782 
 HSM_1249 
 hitC     NTHI0180 
 CGSHiEE_02795 
   HI0099 
 HS_0781 
 HSM_1248 
 Heme biosynthesis   hemA             HS_0810 
 HSM_1279 
 hemB             HS_0548 
 HSM_1661 
 hemC             HS_0044 
 HSM_1937 
 hemD   HD1742 
         HS_0045 
 HSM_1938 
 hemE             HS_1540 
 HSM_0564 
 hemG             HS_1569 
 HSM_0443 
 hemH     NTHI1329 
 CGSHiEE_06240 
   HI1160 
 HS_1047 
 HSM_1531 
 hemL             HS_1229 
 HSM_0850 
 hemM   HD1629 
 NTHI1435 
 CGSHiEE_05685 
 CGSHiGG_10085 
 HI1607 
 HS_0998 
 HSM_1476 
 hemN   HD1668 
 NTHI0594 
 CGSHiEE_00675 
 CGSHiGG_05555 
 HI0463 
 HS_0472 
 HSM_0771 
 hemX   HD1741 
 NTHI0858 
 CGSHiEE_01990 
 CGSHiGG_06950 
 HI0603m 
 HS_0046 
 HSM_1939 
 hemY   HD1740 
 NTHI0857 
 CGSHiEE_01985 
 CGSHiGG_06945 
 HI0602 
 HS_0047 
 HSM_1940 
 hemR     NTHI0202 
     HI0113 
 HS_0728 
 HSM_1176 
 Heme/Hemopexin-binding complex   hxuA     NTHI0371 
 CGSHiEE_01735 
   HI0264 
   
 hxuB     NTHI0370 
 CGSHiEE_01740 
 CGSHiGG_04100 
 HI0263 
   
 hxuC     NTHI0369 
 CGSHiEE_01745 
 CGSHiGG_04095 
 HI0262 
   
 Hemoglobin and hemoglobin-haptoglobin binding proteins (Hgps)   hgpA               
 hgpB     NTHI0782 
 CGSHiEE_00010 
 CGSHiGG_06590 
 HI0661 
   
 hgpC     NTHI0840* 
   CGSHiGG_06875 
 HI0712 
   
 hgpD     NTHI0736* 
         
 -       CGSHiEE_08890 
 CGSHiGG_06430 
     
 hgbA   HD2025 
       HI1565m* 
 HS_0720* 
 HSM_1168 
 Transferrin-binding protein 1   tbpA     NTHI1168 
 CGSHiEE_06995 
   HI0994 
 HS_0449 
 HSM_0750 
 Transferrin-binding protein 2   tbpB     NTHI1169 
 CGSHiEE_06990 
 CGSHiGG_08580 
 HI0995 
 HS_0448 
 HSM_0749 
Toxin
 Cytolethal distending toxin   cdtA   HD0902 
           
 cdtB   HD0903 
           
 cdtC   HD0904 
           
 Hemolysin   hhdA   HD1327 
           
 hhdB   HD1326 
           
Download current table as
EXCEL file
TEXT file
Last update: Wed Dec 19 15:17:59 2018