Home
Search
Category
Status
Feedback
Download
Contacts
Resources



Comparative pathogenomics of Chlamydia ( Total 12 genomes available )

 Virulence factors   Related genes   C. abortus S26/3   C. caviae GPIC   C. felis Fe/C-56   C. muridarum Nigg (MoPn)   C. pneumoniae AR39   C. pneumoniae CWL029   C. pneumoniae J138   C. pneumoniae TW-183   C. trachomatis 434/Bu (serovar L2)   C. trachomatis A/HAR-13 (serovar A)   C. trachomatis D/UW-3/CX (serovar D)   C. trachomatis L2b/UCH-1/proctitis (serovar L2b) 
 chromosome 
 NC_004552 
 chromosome 
 NC_003361 
 chromosome 
 NC_007899 
 chromosome 
 NC_002620 
 chromosome 
 NC_002179 
 chromosome 
 NC_000922 
 chromosome 
 NC_002491 
 chromosome 
 NC_005043 
 chromosome 
 NC_010287 
 chromosome 
 NC_007429 
 chromosome 
 NC_000117 
 chromosome 
 NC_010280 
Adherence
 MOMP 
(Major outer membrane protein) 
 ompA   CAB_RS00265 
 CCA_RS00265 
 CF_RS04810 
 TC_RS00285 
 CP_RS00280 
 CPN_RS03560 
 CPJ_RS03590 
 CPB_RS03560 
 CTL_RS00280 
 CTA_RS03705 
 CT_681 
 CTLON_RS00280 
 OmcB 
(Outer membrane complex protein B) 
 omcB   CAB_RS00965 
 CCA_RS00965 
 CF_RS04115 
 TC_RS03680 
 CP_RS01020 
 CPN_RS02825 
 CPJ_RS02860 
 CPB_RS02830 
 CTL_RS03715 
 CTA_RS02385 
 CT_443 
 CTLON_RS03705 
 Pmps 
(Polymorphic membrane proteins) 
 pmpA   CAB_RS01080 
 CCA_RS01080 
 CF_RS04005 
 TC_RS03510 
 CP_RS01120 
 CPN_RS02725 
 CPJ_RS02760 
 CPB_RS02730 
 CTL_RS03535 
 CTA_RS02205 
 CT_412 
 CTLON_RS03525 
 pmpB   CAB_RS01075 
 CCA_RS01075 
 CF_RS04010 
 TC_RS03515 
 CP_RS01115 
 CPN_RS02730 
 CPJ_RS02765 
 CPB_RS02735 
 CTL_RS03540 
 CTA_RS02210 
 CT_413 
 CTLON_RS03530 
 pmpC         TC_RS03520 
         CTL_RS03545 
 CTA_RS02215 
 CT_414 
 CTLON_RS03535 
 pmpD   CAB_RS03975 
 CCA_RS04035 
 CF_RS01055 
 TC_RS01000 
 CP_RS04485 
 CPN_RS04960 
 CPJ_RS05010 
 CPB_RS04985 
 CTL_RS00995 
 CTA_RS04440 
 CT_812 
 CTLON_RS01015 
 pmpE   CAB_RS01385 
 CAB_RS01390 
 CAB_RS01395 
 CCA_RS01390 
 CCA_RS01380 
 CCA_RS01385 
 CCA_RS01400 
 CF_RS03685 
 CF_RS03670 
 CF_RS03675 
 CF_RS05205 
 CF_RS03690 
 TC_RS01325 
 CP_RS01470 
 CP_RS01475 
 CP_RS01490 
 CPN_RS02365 
 CPN_RS02370 
 CPN_RS02390 
 CPJ_RS02395 
 CPJ_RS02400 
 CPJ_RS02415 
 CPJ_RS02420 
 CPB_RS02365 
 CPB_RS02370 
 CPB_RS02390 
 CTL_RS01310 
 CTA_RS04755 
 CT_869 
 CTLON_RS01335 
 pmpF     CCA_RS01395 
 CF_RS03695 
 TC_RS01330 
 CP_RS01495 
       CTL_RS01315 
 CTA_RS04760 
 CT_870 
 CTLON_RS01340 
 pmpG   CAB_RS01405 
 CAB_RS01440 
 CAB_RS01445 
 CAB_RS01455 
 CAB_RS01460 
 CAB_RS01465 
 CAB_RS03080 
 CCA_RS01410 
 CCA_RS01415 
 CCA_RS01425 
 CCA_RS01430 
 CCA_RS01435 
 CCA_RS01440 
 CCA_RS01445 
 CCA_RS03150 
 CF_RS03660 
 CF_RS03620 
 CF_RS03625 
 CF_RS03635 
 CF_RS03640 
 TC_RS01335 
 CP_RS01560 
 CP_RS01565 
 CP_RS01570 
 CP_RS01575 
 CP_RS01585 
 CP_RS01590 
 CP_RS01595 
 CP_RS01605 
 CP_RS03820 
 CP_RS03830 
 CP_RS03870 
 CPN_RS02300 
 CPN_RS00025 
 CPN_RS00060 
 CPN_RS00070 
 CPN_RS00095 
 CPN_RS02255 
 CPN_RS02265 
 CPN_RS02270 
 CPN_RS02275 
 CPN_RS02290 
 CPJ_RS00025 
 CPJ_RS00080 
 CPJ_RS02295 
 CPJ_RS02300 
 CPJ_RS02305 
 CPJ_RS02310 
 CPJ_RS02320 
 CPJ_RS02325 
 CPJ_RS02330 
 CPJ_RS02335 
 CPJ_RS05630 
 CPB_RS00025 
 CPB_RS00080 
 CPB_RS02265 
 CPB_RS02270 
 CPB_RS02275 
 CPB_RS02280 
 CPB_RS02290 
 CPB_RS02295 
 CPB_RS02300 
 CPB_RS02305 
 CTL_RS01320 
 CTA_RS04765 
 CT_871 
 CTLON_RS01345 
 pmpH   CAB_RS01400 
 CCA_RS01405 
 CF_RS03665 
 TC_RS01340 
 CP_RS01555 
 CPN_RS02305 
 CPJ_RS02340 
 CPB_RS02310 
 CTL_RS01325 
 CTA_RS04770 
 CT_872 
 CTLON_RS01350 
 pmpI         TC_RS01350 
         CTL_RS01335 
 CTA_RS04780 
 CT_874 
 CTLON_RS01360 
Invasion
 Ctad1 
(C. trachomatis adhesin 1) 
 ctad1   CAB_RS03275 
 CCA_RS03355 
 CF_RS01735 
 TC_RS01440 
 CP_RS03355 
 CPN_RS00525 
 CPJ_RS00545 
 CPB_RS00525 
 CTL_RS01425 
 CTA_RS00090 
 CT_017 
 CTLON_RS01455 
Effector delivery system
 TTSS 
(Type III secretion system) 
 scc1   CAB_RS02305 
 CCA_RS02300 
 CF_RS02790 
 TC_RS01810 
 CP_RS02215 
 CPN_RS01665 
 CPJ_RS01695 
 CPB_RS01665 
 CTL_RS01800 
 CTA_RS00460 
 CT_088 
 CTLON_RS01825 
 cdsV   CAB_RS02315 
 CCA_RS02310 
 CF_RS02780 
 TC_RS01820 
 CP_RS02225 
 CPN_RS01655 
 CPJ_RS01685 
 CPB_RS01655 
 CTL_RS01810 
 CTA_RS00470 
 CT_090 
 CTLON_RS01835 
 cdsU   CAB_RS02320 
 CCA_RS02315 
 CF_RS02775 
 TC_RS01825 
 CP_RS02230 
 CPN_RS01650 
 CPJ_RS01680 
 CPB_RS01650 
 CTL_RS01815 
 CTA_RS00475 
 CT_091 
 CTLON_RS01840 
 cdsJ   CAB_RS04645 
 CCA_RS04705 
 CF_RS00400 
 TC_RS04305 
 CP_RS05200 
 CPN_RS04260 
 CPJ_RS04295 
 CPB_RS04270 
 CTL_RS04345 
 CTA_RS03030 
 CT_559 
 CTLON_RS04340 
 cdsL   CAB_RS04655 
 CCA_RS04715 
 CF_RS00390 
 TC_RS04315 
 CP_RS05210 
 CPN_RS04250 
 CPJ_RS04285 
 CPB_RS04260 
 CTL_RS04355 
 CTA_RS03045 
 CT_561 
 CTLON_RS04355 
 cdsR   CAB_RS04660 
 CCA_RS04720 
 CF_RS00385 
 TC_RS04840 
 CP_RS05215 
 CPN_RS04245 
 CPJ_RS04280 
 CPB_RS04255 
 CTL_RS04360 
 CTA_RS03050 
 CT_562 
 CTLON_RS04360 
 cdsS   CAB_RS04665 
 CCA_RS04725 
 CF_RS00380 
 TC_RS04325 
 CP_RS05220 
 CPN_RS04240 
 CPJ_RS04275 
 CPB_RS04250 
 CTL_RS04365 
 CTA_RS03055 
 CT_563 
 CTLON_RS04365 
 cdsT   CAB_RS04670 
 CCA_RS04730 
 CF_RS00375 
 TC_RS04330 
 CP_RS05225 
 CPN_RS04235 
 CPJ_RS04270 
 CPB_RS04245 
 CTL_RS04370 
 CTA_RS03060 
 CT_564 
 CTLON_RS04370 
 scc2   CAB_RS04730 
 CCA_RS04790 
 CF_RS00315 
 TC_RS04390 
 CP_RS05285 
 CPN_RS04175 
 CPJ_RS04210 
 CPB_RS04185 
 CTL_RS04430 
 CTA_RS03120 
 CT_576 
 CTLON_RS04430 
 copB   CAB_RS04740 
 CCA_RS04800 
 CF_RS00305 
 TC_RS04400 
 CP_RS05295 
 CPN_RS04165 
 CPJ_RS04200 
 CPB_RS04175 
 CTL_RS04440 
 CTA_RS03130 
 CT_578 
 CTLON_RS04440 
 copD   CAB_RS04745 
 CCA_RS04805 
 CF_RS00300 
 TC_RS04405 
 CP_RS05300 
 CPN_RS04160 
 CPJ_RS04195 
 CPB_RS04170 
 CTL_RS04445 
 CTA_RS03135 
 CT_579 
 CTLON_RS04445 
 cdsN   CAB_RS00185 
 CCA_RS00185 
 CF_RS04890 
 TC_RS00205 
 CP_RS00200 
 CPN_RS03640 
 CPJ_RS03670 
 CPB_RS03640 
 CTL_RS00200 
 CTA_RS03625 
 CT_669 
 CTLON_RS00200 
 cdsQ   CAB_RS00200 
 CCA_RS00200 
 CF_RS04875 
 TC_RS00220 
 CP_RS00215 
 CPN_RS03625 
 CPJ_RS03655 
 CPB_RS03625 
 CTL_RS00215 
 CTA_RS03640 
 CT_672 
 CTLON_RS00215 
 cdsC   CAB_RS00210 
 CCA_RS00210 
 CF_RS04865 
 TC_RS00230 
 CP_RS00225 
 CPN_RS03615 
 CPJ_RS03645 
 CPB_RS03615 
 CTL_RS00225 
 CTA_RS03650 
 CT_674 
 CTLON_RS00225 
 copB2   CAB_RS03655 
 CCA_RS03720 
 CF_RS01375 
 TC_RS01265 
 CP_RS04180 
 CPN_RS05265 
 CPJ_RS05290 
 CPB_RS05270 
 CTL_RS01260 
 CTA_RS04705 
 CT_861 
 CTLON_RS01285 
 scc3   CAB_RS03650 
 CCA_RS03715 
 CF_RS01380 
 TC_RS01270 
 CP_RS04175 
 CPN_RS05270 
 CPJ_RS05295 
 CPB_RS05275 
 CTL_RS01265 
 CTA_RS04710 
 CT_862 
 CTLON_RS01290 
 cdsD   CAB_RS00160 
 CCA_RS00160 
 CF_RS04915 
 TC_RS00180 
 CP_RS00175 
 CPN_RS03665 
 CPJ_RS03695 
 CPB_RS03665 
 CTL_RS00175 
 CTA_RS03600 
 CT_664 
 CTLON_RS00175 
 cdsE   CAB_RS00165 
 CCA_RS00165 
 CF_RS04910 
 TC_RS00185 
 CP_RS00180 
 CPN_RS03660 
 CPJ_RS03690 
 CPB_RS03660 
 CTL_RS00180 
 CTA_RS03605 
 CT_665 
 CTLON_RS00180 
 cdsF   CAB_RS00170 
 CCA_RS00170 
 CF_RS04905 
 TC_RS00190 
 CP_RS00185 
 CPN_RS03655 
 CPJ_RS03685 
 CPB_RS03655 
 CTL_RS00185 
 CTA_RS03610 
 CT_666 
 CTLON_RS00185 
 cdsG   CAB_RS00175 
 CCA_RS00175 
 CF_RS04900 
 TC_RS00195 
 CP_RS00190 
 CPN_RS03650 
 CPJ_RS03680 
 CPB_RS03650 
 CTL_RS00190 
 CTA_RS03615 
 CT_667 
 CTLON_RS00190 
 cdsO   CAB_RS00190 
 CCA_RS00190 
 CF_RS04885 
 TC_RS00210 
 CP_RS00205 
 CPN_RS03635 
 CPJ_RS03665 
 CPB_RS03635 
 CTL_RS00205 
 CTA_RS03630 
 CT_670 
 CTLON_RS00205 
 cdsP   CAB_RS00195 
 CCA_RS00195 
 CF_RS04880 
 TC_RS00215 
 CP_RS00210 
 CPN_RS03630 
 CPJ_RS03660 
 CPB_RS03630 
 CTL_RS00210 
 CTA_RS03635 
 CT_671 
 CTLON_RS00210 
 cdsZ   CAB_RS01150 
 CCA_RS01150 
 CF_RS03935 
 TC_RS03440 
 CP_RS01195 
 CPN_RS02650 
 CPJ_RS02690 
 CPB_RS02660 
 CTL_RS03460 
 CTA_RS02135 
 CT_398 
 CTLON_RS03455 
 scc4   CAB_RS00155 
 CCA_RS00155 
 CF_RS04920 
 TC_RS00175 
 CP_RS00170 
 CPN_RS03670 
 CPJ_RS03700 
 CPB_RS03670 
 CTL_RS00170 
 CTA_RS03595 
 CT_663 
 CTLON_RS00170 
 -   CAB_RS04770 
 CCA_RS04830 
 CF_RS00275 
 TC_RS04430 
 CP_RS05325 
 CPN_RS04135 
 CPJ_RS04170 
 CPB_RS04145 
 CTL_RS04470 
 CTA_RS03160 
 CT_584 
 CTLON_RS04475 
 slc1   CAB_RS02060 
 CCA_RS02055 
 CF_RS03030 
 TC_RS01570 
 CP_RS01905 
 CPN_RS01960 
 CPJ_RS02005 
 CPB_RS01975 
 CTL_RS01570 
 CTA_RS00230 
 CT_043 
 CTLON_RS01595 
 mcsc   CAB_RS01945 
 CCA_RS01940 
 CF_RS03150 
 TC_RS02695 
 CP_RS01785 
 CPN_RS02075 
 CPJ_RS02115 
 CPB_RS02085 
 CTL_RS02710 
 CTA_RS01395 
 CT_260 
 CTLON_RS02720 
 TTSS secreted effectors   copN   CAB_RS02310 
 CCA_RS02305 
 CF_RS02785 
 TC_RS01815 
 CP_RS02220 
 CPN_RS01660 
 CPJ_RS01690 
 CPB_RS01660 
 CTL_RS01805 
 CTA_RS00465 
 CT_089 
 CTLON_RS01830 
 pkn5   CAB_RS00205 
 CCA_RS00205 
 CF_RS04870 
 TC_RS00225 
 CP_RS00220 
 CPN_RS03620 
 CPJ_RS03650 
 CPB_RS03620 
 CTL_RS00220 
 CTA_RS03645 
 CT_673 
 CTLON_RS00220 
 -   CAB_RS03740 
 CCA_RS03805 
 CF_RS01290 
 TC_RS01185 
 CP_RS04260 
 CPN_RS05185 
 CPJ_RS05210 
 CPB_RS05190 
 CTL_RS01185 
 CTA_RS04625 
 CT_847 
 CTLON_RS01200 
 tarp   CAB_RS00890 
 CCA_RS00890 
 CF_RS04190 
 TC_RS03750 
 CP_RS00945 
 CPN_RS02900 
 CPJ_RS02935 
 CPB_RS02905 
 CTL_RS03785 
 CTA_RS02465 
 CT_456 
 CTLON_RS03780 
 incA   CAB_RS02780 
 CCA_RS02780 
 CF_RS02320 
 CF_RS04260 
 TC_RS01965 
 CP_RS02935 
 CPN_RS00950 
 CPJ_RS00965 
 CPB_RS00945 
 CTL_RS01955 
 CTA_RS00620 
 CT_119 
 CTLON_RS01980 
 incB   CAB_RS02475 
 CCA_RS02470 
 CF_RS02620 
 TC_RS04805 
 CP_RS02385 
 CPN_RS01495 
 CPJ_RS01525 
 CPB_RS01495 
 CTL_RS02565 
 CTA_RS01255 
 CT_232 
 CTLON_RS02580 
 incC   CAB_RS02470 
 CCA_RS02465 
 CF_RS02625 
 TC_RS02560 
 CP_RS02380 
 CPN_RS01500 
 CPJ_RS01530 
 CPB_RS01500 
 CTL_RS02570 
 CTA_RS01260 
 CT_233 
 CTLON_RS02585 
 tmeA         TC_RS00350 
         CTL_RS00345 
 CTA_RS03770 
 CT_694 
 CTLON_RS00345 
 incD         TC_RS01945 
         CTL_RS01935 
 CTA_RS00600 
 CT_115 
 CTLON_RS01960 
 incE         TC_RS01950 
         CTL_RS01940 
 CTA_RS00605 
 CT_116 
 CTLON_RS01965 
 incG         TC_RS01960 
         CTL_RS01950 
 CTA_RS00615 
 CT_118 
 CTLON_RS01975 
 -         TC_RS02535 
         CTL_RS02545 
 CTA_RS01235 
 CT_228 
 CTLON_RS02560 
 cpoS         TC_RS02540 
         CTL_RS02550 
 CTA_RS01240 
 CT_229 
 CTLON_RS02565 
 inaC         TC_RS01005 
         CTL_RS01000 
 CTA_RS04445 
 CT_813 
 CTLON_RS01020 
 -   CAB_RS03720 
 CCA_RS03785 
 CF_RS01310 
 TC_RS01205 
 CP_RS04240 
 CPN_RS05205 
 CPJ_RS05230 
 CPB_RS05210 
 CTL_RS01205 
 CTA_RS04645 
 CT_850 
 CTLON_RS01220 
 NUE   CAB_RS04410 
 CCA_RS04470 
 CF_RS00635 
 TC_RS00575 
 CP_RS04945 
 CPN_RS04505 
 CPJ_RS04550 
 CPB_RS04525 
 CTL_RS00565 
 CTA_RS03995 
 CT_737 
 CTLON_RS00570 
 tepP         TC_RS01355 
         CTL_RS01340 
 CTA_RS00005 
 CT_875 
 CTLON_RS01370 
 -   CAB_RS02275 
 CCA_RS02270 
 CF_RS02820 
 TC_RS01780 
 CP_RS02185 
 CPN_RS01695 
 CPJ_RS01725 
 CPB_RS01695 
 CTL_RS01770 
 CTA_RS00430 
 CT_082 
 CTLON_RS01795 
 ChlaOTU   CAB_RS01335 
 CCA_RS01330 
 CF_RS03745 
                 
 -           CP_RS00875 
 CPN_RS02970 
 CPJ_RS03005 
 CPB_RS02975 
       
Exoenzyme
 CPAF 
(Chlamydial protease-like activating factor ) 
 -   CAB_RS03675 
 CCA_RS03740 
 CF_RS01355 
 TC_RS01250 
 CP_RS04200 
 CPN_RS05245 
 CPJ_RS05270 
 CPB_RS05250 
 CTL_RS01245 
 CTA_RS04690 
 CT_858 
 CTLON_RS01270 
Download current table as
EXCEL file
Back to top
Last update: Wed Apr 27 17:05:44 2022
2004-2022 IPB, CAMS&PUMC